More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0788 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 603 aa  1230    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  46.89 
 
 		 613 aa  498  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  44.89 
 
 		 618 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  41.31 
 
 		 664 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  50.8 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  42.83 
 
 		 612 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  41.64 
 
 		 626 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  47.62 
 
 		 527 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  47.2 
 
 		 519 aa  362  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  34.92 
 
 		 622 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  32.8 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 572 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 591 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.37 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 601 aa  150  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.98 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.72 
 
 		 494 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  30.84 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.79 
 
 		 477 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  31.29 
 
 		 501 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 499 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 476 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 506 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 493 aa  131  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 522 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.29 
 
 		 499 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 480 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 498 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 506 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 527 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.22 
 
 		 494 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 503 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 514 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 503 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 473 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0184  RagB/SusD domain-containing protein  28.79 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0583886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.72 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 592 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  32.38 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 486 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 507 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.19 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.77 
 
 		 511 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 531 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  26.06 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 514 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  29.73 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 521 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 497 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 505 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 480 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 556 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 496 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  30.07 
 
 		 458 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 488 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 513 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 541 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 519 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.13 
 
 		 507 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 461 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 537 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 472 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 494 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 510 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 491 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 491 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>