243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5754 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 3471 aa  6642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.37 
 
 		 4896 aa  550  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  42.56 
 
 		 3793 aa  453  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  26.26 
 
 		 4897 aa  412  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  40.37 
 
 		 4978 aa  371  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  28.09 
 
 		 3921 aa  363  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  28.3 
 
 		 3602 aa  351  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1332 aa  225  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  53.37 
 
 		 2377 aa  204  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  40.73 
 
 		 3927 aa  192  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  31.66 
 
 		 983 aa  190  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  27.49 
 
 		 1989 aa  181  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1059 aa  174  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  28.74 
 
 		 2573 aa  172  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  29.19 
 
 		 1293 aa  163  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1537 aa  159  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  28.9 
 
 		 3634 aa  156  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  32.39 
 
 		 1118 aa  147  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  26.49 
 
 		 5010 aa  140  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  26.23 
 
 		 5010 aa  137  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  25.48 
 
 		 5017 aa  130  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  28.18 
 
 		 2520 aa  130  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  25.48 
 
 		 5017 aa  130  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  25.97 
 
 		 5010 aa  130  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.52 
 
 		 2490 aa  130  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.24 
 
 		 2490 aa  128  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1227 aa  128  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  24.72 
 
 		 2489 aa  128  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.65 
 
 		 2490 aa  127  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  27.78 
 
 		 2520 aa  127  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  26.75 
 
 		 3911 aa  126  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  26.41 
 
 		 5010 aa  125  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  26.11 
 
 		 5017 aa  125  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  25.58 
 
 		 5017 aa  124  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  26.28 
 
 		 2485 aa  123  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  25.5 
 
 		 5017 aa  120  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  26.2 
 
 		 2487 aa  120  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  26.19 
 
 		 2490 aa  120  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  26.8 
 
 		 2490 aa  116  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  25.13 
 
 		 3771 aa  115  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1809 aa  113  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1202 aa  110  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  25.92 
 
 		 2358 aa  108  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  26.18 
 
 		 2358 aa  106  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  26.2 
 
 		 8918 aa  105  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  34.85 
 
 		 2478 aa  101  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  32.88 
 
 		 744 aa  101  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1441 aa  99  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  48.24 
 
 		 315 aa  97.1  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  32.99 
 
 		 2267 aa  93.6  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1898 aa  92  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  24.26 
 
 		 3521 aa  91.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  28.28 
 
 		 2121 aa  90.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  24.61 
 
 		 3471 aa  90.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 599 aa  88.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  23.52 
 
 		 3360 aa  86.7  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  39.66 
 
 		 3227 aa  85.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  24.08 
 
 		 3472 aa  85.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  26.56 
 
 		 3920 aa  85.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  40.22 
 
 		 1483 aa  85.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  37.61 
 
 		 2421 aa  85.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  37.61 
 
 		 2411 aa  84.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  37.61 
 
 		 2367 aa  84.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  31.31 
 
 		 2602 aa  83.6  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  44.68 
 
 		 1059 aa  83.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  40.82 
 
 		 2454 aa  82.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  40.82 
 
 		 2807 aa  81.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  25.54 
 
 		 2490 aa  80.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  39.58 
 
 		 2772 aa  79.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  35.71 
 
 		 2270 aa  78.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1259 aa  77  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.12 
 
 		 3191 aa  75.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  37.27 
 
 		 2402 aa  74.7  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  28.8 
 
 		 1150 aa  73.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  23.46 
 
 		 3409 aa  73.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1067 aa  73.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  26.13 
 
 		 1857 aa  73.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1547 aa  71.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  43.69 
 
 		 3089 aa  68.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  31.43 
 
 		 775 aa  68.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  26.52 
 
 		 2113 aa  68.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  34.34 
 
 		 2005 aa  68.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  45.12 
 
 		 3474 aa  67.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  31.37 
 
 		 3737 aa  68.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  25.19 
 
 		 1168 aa  68.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  40.95 
 
 		 1706 aa  67.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  30.26 
 
 		 621 aa  67.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.13 
 
 		 815 aa  67  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.68 
 
 		 2927 aa  67  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  46.58 
 
 		 1269 aa  66.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  34.44 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  46.05 
 
 		 1269 aa  65.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  41.18 
 
 		 1111 aa  65.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  32.99 
 
 		 711 aa  65.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.69 
 
 		 1519 aa  65.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 		 2588 aa  66.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  46.75 
 
 		 2839 aa  65.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  34.44 
 
 		 657 aa  65.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  42.53 
 
 		 1268 aa  65.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  38.2 
 
 		 3542 aa  64.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>