137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1586 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 852 aa  1769    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  34.51 
 
 		 886 aa  320  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1093 aa  317  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  34.29 
 
 		 1063 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  34.76 
 
 		 667 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  31.6 
 
 		 709 aa  275  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  31.66 
 
 		 886 aa  274  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  33.22 
 
 		 661 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  28.48 
 
 		 742 aa  259  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  30.24 
 
 		 891 aa  244  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  31.64 
 
 		 734 aa  243  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  28.65 
 
 		 863 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  26.72 
 
 		 998 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  26.14 
 
 		 1008 aa  101  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3626  hypothetical protein  50 
 
 		 576 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00173227  normal  0.0443221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  45.34 
 
 		 292 aa  87.8  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  43.57 
 
 		 780 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  37.86 
 
 		 2005 aa  82.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  39.58 
 
 		 3662 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  24.84 
 
 		 783 aa  80.5  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  44.83 
 
 		 1064 aa  74.3  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  46.51 
 
 		 3602 aa  71.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  38.96 
 
 		 1059 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  38.74 
 
 		 3737 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  44.94 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2435  Thrombospondin type 3 repeat protein  45.16 
 
 		 522 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 3793 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  43.06 
 
 		 1371 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  40.26 
 
 		 3227 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  37.96 
 
 		 871 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  39.73 
 
 		 750 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1665 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6058  hypothetical protein  51.61 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  41.1 
 
 		 1389 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1259 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  45.76 
 
 		 1362 aa  61.6  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  41.79 
 
 		 2421 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  41.79 
 
 		 2454 aa  61.6  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  38.36 
 
 		 2807 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  41.79 
 
 		 2367 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  35.63 
 
 		 2772 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  41.79 
 
 		 2411 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  35.85 
 
 		 2588 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  38.27 
 
 		 822 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  36.36 
 
 		 627 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  31.78 
 
 		 503 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.14 
 
 		 2296 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 1264 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1066 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  41.43 
 
 		 2927 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  50.98 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  39.29 
 
 		 799 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  51.85 
 
 		 683 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  51.85 
 
 		 683 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.83 
 
 		 447 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  35.06 
 
 		 561 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  41.89 
 
 		 636 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1139 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  41.94 
 
 		 1526 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  42.5 
 
 		 815 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.13 
 
 		 420 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  47.46 
 
 		 1935 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  43.86 
 
 		 4896 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  42.31 
 
 		 599 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 458 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.64 
 
 		 542 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  42.42 
 
 		 792 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1987 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  32.79 
 
 		 3324 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1547 aa  55.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  32.86 
 
 		 727 aa  55.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.61 
 
 		 478 aa  55.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 		 544 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1461 aa  55.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  39.13 
 
 		 1162 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  43.28 
 
 		 885 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  37.97 
 
 		 1483 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  39.62 
 
 		 637 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.78 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.51 
 
 		 711 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  34.31 
 
 		 2267 aa  52.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  38.89 
 
 		 4013 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  33.04 
 
 		 794 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3470  hypothetical protein  61.54 
 
 		 2836 aa  52  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0237631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 487 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.46 
 
 		 623 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 540 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  34.12 
 
 		 401 aa  51.2  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 2022 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 322 aa  51.2  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  32.67 
 
 		 402 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  36 
 
 		 1210 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  31.9 
 
 		 2487 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5288  hypothetical protein  38.3 
 
 		 688 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  32.56 
 
 		 429 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.41 
 
 		 5745 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.8 
 
 		 2377 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  33.04 
 
 		 314 aa  50.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  35.82 
 
 		 969 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>