149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1251 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  100 
 
 
1259 aa  2551    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  42.42 
 
 
2772 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  47.47 
 
 
2411 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  47.47 
 
 
2367 aa  186  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  47 
 
 
2421 aa  184  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  47 
 
 
2454 aa  184  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  47 
 
 
2807 aa  184  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  47.78 
 
 
750 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  34.15 
 
 
1059 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  27.29 
 
 
976 aa  133  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  34.87 
 
 
4978 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  26.89 
 
 
1976 aa  127  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  36.16 
 
 
1371 aa  115  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  31.08 
 
 
627 aa  108  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  38.55 
 
 
822 aa  104  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.22 
 
 
1162 aa  95.9  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  33.46 
 
 
2418 aa  94.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  39.53 
 
 
3793 aa  92  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  51.14 
 
 
815 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  33.71 
 
 
2064 aa  89.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  35.21 
 
 
799 aa  89.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  27.65 
 
 
794 aa  89  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  26.68 
 
 
953 aa  88.6  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  28.63 
 
 
1389 aa  86.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  35.29 
 
 
1526 aa  84.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  36.26 
 
 
1547 aa  82  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  31.71 
 
 
1483 aa  81.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  34.27 
 
 
637 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  42.45 
 
 
4896 aa  78.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  36.23 
 
 
3471 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  47.31 
 
 
1139 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  34.23 
 
 
1066 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  28.17 
 
 
792 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  29.91 
 
 
707 aa  76.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  28.06 
 
 
642 aa  76.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  39.25 
 
 
2927 aa  75.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  37.38 
 
 
2296 aa  74.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.25 
 
 
886 aa  74.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.9 
 
 
3227 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.65 
 
 
1620 aa  71.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  36.63 
 
 
1436 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  25.94 
 
 
1606 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  31.79 
 
 
885 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  43.62 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  31.3 
 
 
2377 aa  68.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  37.63 
 
 
871 aa  68.6  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  43.48 
 
 
3602 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  35.25 
 
 
2588 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  22.89 
 
 
1287 aa  68.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  30.37 
 
 
1064 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  32.67 
 
 
599 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  37.76 
 
 
5745 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.28 
 
 
3927 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  26.69 
 
 
5298 aa  66.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  34.01 
 
 
1488 aa  65.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  29.27 
 
 
1152 aa  65.1  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  38.04 
 
 
2022 aa  64.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  35.96 
 
 
2005 aa  63.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  35.19 
 
 
751 aa  62.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  35.16 
 
 
3737 aa  62.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  36.61 
 
 
676 aa  62.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 
561 aa  62.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  34.34 
 
 
2487 aa  62.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  37.14 
 
 
3958 aa  62.4  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  38.67 
 
 
852 aa  62  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  30 
 
 
808 aa  62  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  36.62 
 
 
429 aa  62  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.27 
 
 
1313 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  38.71 
 
 
2270 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  26.56 
 
 
774 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.32 
 
 
1987 aa  61.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  40 
 
 
860 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  34.09 
 
 
4044 aa  61.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.88 
 
 
890 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  32.35 
 
 
969 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  31.29 
 
 
1140 aa  60.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  37.04 
 
 
1222 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  40 
 
 
2364 aa  60.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  32.28 
 
 
694 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  32.35 
 
 
963 aa  60.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.32 
 
 
3191 aa  60.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.88 
 
 
6497 aa  59.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  28.74 
 
 
662 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  32.71 
 
 
2980 aa  59.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  36.52 
 
 
2267 aa  58.9  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  24.18 
 
 
938 aa  58.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  29.31 
 
 
1466 aa  58.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  25.45 
 
 
1461 aa  58.5  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  35.09 
 
 
1032 aa  58.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.12 
 
 
636 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  31.91 
 
 
711 aa  58.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  33.67 
 
 
1665 aa  57.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  35.19 
 
 
1193 aa  57.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  30.43 
 
 
1210 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  29.32 
 
 
540 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  29.73 
 
 
650 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  28.89 
 
 
1980 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  32.89 
 
 
3324 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  36.73 
 
 
640 aa  55.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2001  phosphoesterase  30.77 
 
 
626 aa  55.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>