179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3798 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 		 1526 aa  3019    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.89 
 
 		 4855 aa  331  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.21 
 
 		 2296 aa  282  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.75 
 
 		 3589 aa  281  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.3 
 
 		 2744 aa  280  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.2 
 
 		 2927 aa  250  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  54.49 
 
 		 3227 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1439 aa  197  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  64.86 
 
 		 1066 aa  163  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1263 aa  147  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  37.29 
 
 		 350 aa  144  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1318 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  35.13 
 
 		 2716 aa  143  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  32.97 
 
 		 1332 aa  141  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1055 aa  138  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  29.87 
 
 		 799 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  34.16 
 
 		 852 aa  136  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1994 aa  135  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  29.34 
 
 		 507 aa  133  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  32.2 
 
 		 2192 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  33.39 
 
 		 2042 aa  129  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  30.26 
 
 		 2271 aa  128  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  36.92 
 
 		 417 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1010 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  27.1 
 
 		 743 aa  108  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1585 aa  106  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.01 
 
 		 5613 aa  103  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  34.82 
 
 		 1588 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  38.25 
 
 		 2064 aa  102  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  28.02 
 
 		 1371 aa  101  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  28.08 
 
 		 775 aa  97.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1259 aa  95.5  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  29.29 
 
 		 2421 aa  94.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  30.05 
 
 		 2367 aa  94  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  29.29 
 
 		 2454 aa  94.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.29 
 
 		 2807 aa  94.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  28.85 
 
 		 1389 aa  94  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  29.29 
 
 		 2411 aa  94.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  33.54 
 
 		 792 aa  90.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  30.95 
 
 		 2772 aa  90.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  27.6 
 
 		 3920 aa  90.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  28.03 
 
 		 1170 aa  90.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  27.96 
 
 		 750 aa  89.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  31.79 
 
 		 815 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.26 
 
 		 1296 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  45.35 
 
 		 3602 aa  87.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  32.3 
 
 		 822 aa  85.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  28.79 
 
 		 1216 aa  84  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  42 
 
 		 4896 aa  84  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1059 aa  82.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  43.82 
 
 		 3737 aa  82.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1547 aa  81.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.71 
 
 		 627 aa  80.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30 
 
 		 1162 aa  80.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1139 aa  80.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  31.49 
 
 		 1999 aa  80.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.79 
 
 		 2217 aa  79.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  30.33 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  35.29 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  32.64 
 
 		 1092 aa  78.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.78 
 
 		 890 aa  78.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  39.13 
 
 		 794 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1064 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  37.29 
 
 		 561 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1294 aa  76.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  36.93 
 
 		 924 aa  75.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1106 aa  75.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  37.42 
 
 		 1154 aa  75.1  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.48 
 
 		 799 aa  74.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.06 
 
 		 6497 aa  74.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1193 aa  74.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  32.03 
 
 		 774 aa  72  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1032 aa  72  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  34.1 
 
 		 1371 aa  72  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  35.45 
 
 		 599 aa  71.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29.63 
 
 		 1275 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1210 aa  70.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 1097 aa  69.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  33.04 
 
 		 5298 aa  69.3  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40 
 
 		 2377 aa  68.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.89 
 
 		 2042 aa  68.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  36.36 
 
 		 2005 aa  68.6  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  35.45 
 
 		 3958 aa  67  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1461 aa  67.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  35 
 
 		 1634 aa  67.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.52 
 
 		 1755 aa  67  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.33 
 
 		 2503 aa  66.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  36.47 
 
 		 1483 aa  66.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  24.48 
 
 		 886 aa  65.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  34.57 
 
 		 726 aa  65.1  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.09 
 
 		 2522 aa  64.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  37.65 
 
 		 315 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  35.62 
 
 		 1451 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  28.14 
 
 		 1466 aa  64.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  25.71 
 
 		 1606 aa  64.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 		 2588 aa  64.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.95 
 
 		 1672 aa  64.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.23 
 
 		 1848 aa  63.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36 
 
 		 3191 aa  63.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  31.28 
 
 		 885 aa  62.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>