42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1921 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  708    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  45.11 
 
 		 417 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  34.94 
 
 		 852 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  37.29 
 
 		 1526 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  36.54 
 
 		 1332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  32.04 
 
 		 1010 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  34.25 
 
 		 799 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  32.34 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.48 
 
 		 2192 aa  95.9  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1106 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  30.92 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1318 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.54 
 
 		 1296 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1055 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  27.79 
 
 		 743 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  32.13 
 
 		 1092 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  27.61 
 
 		 775 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  34.19 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  45.98 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  25.88 
 
 		 1216 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  36.67 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  32.62 
 
 		 468 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.84 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  34.43 
 
 		 5453 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  44 
 
 		 842 aa  49.7  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.09 
 
 		 483 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  23.88 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.64 
 
 		 1755 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  33.7 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  28.91 
 
 		 477 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  33.71 
 
 		 477 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.71 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  33.55 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  31.72 
 
 		 476 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.38 
 
 		 767 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.93 
 
 		 575 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.27 
 
 		 863 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  32.32 
 
 		 505 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  33.06 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  33.02 
 
 		 558 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  33.91 
 
 		 362 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>