95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3646 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  74.29 
 
 
483 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  77.3 
 
 
476 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 
509 aa  1001    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  76.05 
 
 
477 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  49.76 
 
 
481 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  46.15 
 
 
501 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  40.2 
 
 
461 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.59 
 
 
479 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  41.25 
 
 
450 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  41.3 
 
 
468 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.5 
 
 
464 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  40.91 
 
 
466 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  39.37 
 
 
464 aa  206  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  42.52 
 
 
461 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  41.46 
 
 
459 aa  205  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  38.68 
 
 
462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.8 
 
 
465 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  37.65 
 
 
465 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  37.96 
 
 
459 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  40 
 
 
460 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  40.46 
 
 
439 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  41.85 
 
 
464 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  40.24 
 
 
435 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  41.75 
 
 
361 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  39.22 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  39.45 
 
 
467 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  37.47 
 
 
454 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.52 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  38.26 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  38.42 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.45 
 
 
478 aa  173  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  35.04 
 
 
473 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  34.22 
 
 
477 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  38.16 
 
 
455 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  40.23 
 
 
454 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  40.21 
 
 
415 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  39.23 
 
 
446 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.8 
 
 
462 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  40.73 
 
 
505 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  40.66 
 
 
557 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  38.52 
 
 
466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  36.06 
 
 
477 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  38.5 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  40.37 
 
 
433 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  32.98 
 
 
523 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  32.53 
 
 
532 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  37.79 
 
 
435 aa  159  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  34.27 
 
 
441 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  38.08 
 
 
493 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  35.73 
 
 
489 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  39.85 
 
 
462 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  38.41 
 
 
464 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  40.4 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  33.01 
 
 
476 aa  154  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  37.82 
 
 
496 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  39.13 
 
 
448 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  35.38 
 
 
673 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  45.67 
 
 
840 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.57 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.03 
 
 
541 aa  80.1  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.06 
 
 
759 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  28.4 
 
 
863 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  32.2 
 
 
1296 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  25.93 
 
 
575 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.18 
 
 
767 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  35.03 
 
 
1755 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  36.67 
 
 
350 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  38.58 
 
 
362 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  36.54 
 
 
523 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.77 
 
 
2160 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32.46 
 
 
1037 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.23 
 
 
852 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  29.91 
 
 
743 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.33 
 
 
884 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.57 
 
 
1061 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  28.41 
 
 
1359 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  38.73 
 
 
1092 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  28.85 
 
 
1010 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  29.92 
 
 
786 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.09 
 
 
1800 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  33.97 
 
 
717 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.87 
 
 
1197 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  26.67 
 
 
575 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  32.76 
 
 
987 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.29 
 
 
558 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  34.72 
 
 
272 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  30.69 
 
 
527 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.3 
 
 
2192 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  26.06 
 
 
665 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.17 
 
 
2031 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  26.83 
 
 
1023 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  34.68 
 
 
168 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  26.2 
 
 
591 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.54 
 
 
1318 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_002620  TC0694  polymorphic membrane protein B/C family protein  27.4 
 
 
1672 aa  44.3  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>