86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4376 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 464 aa  911    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  57.87 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  63.38 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  61.97 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  58.11 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  61.15 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  59.79 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  57.02 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  54.35 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  60.85 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  58.19 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  56.14 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  57.72 
 
 		 468 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  59.21 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  56.56 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  54.88 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  54.34 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  59.31 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  57.48 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  56.55 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  55.79 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.06 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  62.05 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  54.24 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  56.9 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  54.13 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  49.61 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  53.72 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  54.57 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.34 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  53.61 
 
 		 432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  53.85 
 
 		 476 aa  362  9e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.6 
 
 		 478 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  54.48 
 
 		 435 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  53.09 
 
 		 496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  54.61 
 
 		 441 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  56.18 
 
 		 446 aa  347  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  55.48 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  53.78 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  52.45 
 
 		 464 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  54.21 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  54.05 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  48.65 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  50 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  52.85 
 
 		 415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  49.27 
 
 		 473 aa  281  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  37.71 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  39.02 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  40.65 
 
 		 483 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  37.19 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.44 
 
 		 481 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.01 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  32.97 
 
 		 523 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  41.03 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.25 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.18 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  35.14 
 
 		 673 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  37.44 
 
 		 840 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.97 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  32.41 
 
 		 759 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  41.1 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.04 
 
 		 767 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.71 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.36 
 
 		 863 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.9 
 
 		 2160 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  41.73 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.03 
 
 		 1296 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27 
 
 		 541 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  32.77 
 
 		 350 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  38.79 
 
 		 1037 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.96 
 
 		 852 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  26.85 
 
 		 527 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  50.88 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.97 
 
 		 884 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  28 
 
 		 1023 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.97 
 
 		 558 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  27.68 
 
 		 1332 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  36.19 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1106 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  27.17 
 
 		 593 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.49 
 
 		 575 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  37.96 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  30.82 
 
 		 1755 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  27.78 
 
 		 601 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  24.9 
 
 		 518 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>