74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0765 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.33 
 
 		 479 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  32.6 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  33.03 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  33.48 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  40 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  33.64 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  42.97 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  35.71 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  40.95 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  33 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  35.85 
 
 		 462 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  33.87 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.95 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  41.88 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.25 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  34.62 
 
 		 1092 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.48 
 
 		 884 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  36.52 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  32.08 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  34.45 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  34.81 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.24 
 
 		 759 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  33.92 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  36.51 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  34.91 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  30.38 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  34.47 
 
 		 489 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  34.2 
 
 		 468 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1003 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  30.98 
 
 		 446 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  32.73 
 
 		 558 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  35.71 
 
 		 523 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  37.9 
 
 		 1332 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  30.77 
 
 		 461 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  38.46 
 
 		 465 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  37.5 
 
 		 433 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  44.74 
 
 		 439 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  49.15 
 
 		 496 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  40 
 
 		 2160 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  33.83 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  29.38 
 
 		 461 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.18 
 
 		 465 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  40.15 
 
 		 467 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.91 
 
 		 462 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  32.02 
 
 		 840 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  31.95 
 
 		 509 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  51.72 
 
 		 441 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  36.13 
 
 		 673 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  31.49 
 
 		 454 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.56 
 
 		 863 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  42.74 
 
 		 717 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  49.12 
 
 		 452 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  41.79 
 
 		 462 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.38 
 
 		 575 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.11 
 
 		 2192 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  40.91 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  32.67 
 
 		 432 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  42.62 
 
 		 455 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1106 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  32.12 
 
 		 601 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  32.91 
 
 		 1296 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  38.14 
 
 		 435 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  29.57 
 
 		 493 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  34.78 
 
 		 466 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  32.62 
 
 		 457 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  32.2 
 
 		 575 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.03 
 
 		 767 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.41 
 
 		 541 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  32.31 
 
 		 593 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  31.61 
 
 		 532 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.87 
 
 		 1037 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.82 
 
 		 852 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 842 aa  42.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>