70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3285 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1060    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  70.09 
 
 
523 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.47 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  35.42 
 
 
454 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  37.95 
 
 
361 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  34.17 
 
 
464 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.8 
 
 
479 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  33.98 
 
 
454 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  37.56 
 
 
460 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  34.52 
 
 
462 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  36.1 
 
 
461 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  36.08 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  34.62 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  36.79 
 
 
452 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  35.18 
 
 
468 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  33.08 
 
 
461 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  34.15 
 
 
481 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  35.08 
 
 
466 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  31.75 
 
 
509 aa  169  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  36.79 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  34.87 
 
 
455 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  32.88 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  33.48 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  51.06 
 
 
840 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  33.1 
 
 
459 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  35.75 
 
 
505 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  33.56 
 
 
439 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  35.32 
 
 
462 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.65 
 
 
462 aa  160  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  34.87 
 
 
464 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  43.94 
 
 
673 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  33.93 
 
 
441 aa  157  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  34.62 
 
 
435 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.04 
 
 
483 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.88 
 
 
464 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  35.89 
 
 
435 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.43 
 
 
478 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  32.81 
 
 
476 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.04 
 
 
477 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  33.39 
 
 
501 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  31.92 
 
 
557 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  31.71 
 
 
454 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  34.23 
 
 
457 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  30.63 
 
 
477 aa  143  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  33.26 
 
 
493 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  33.65 
 
 
433 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  33.73 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  32.44 
 
 
489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  33.57 
 
 
446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  33.41 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  35.14 
 
 
432 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  35.12 
 
 
477 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  33.26 
 
 
473 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  31.56 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  32.2 
 
 
415 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  37.37 
 
 
476 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  28.41 
 
 
448 aa  86.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  51.16 
 
 
496 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.18 
 
 
575 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.69 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  36.84 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.39 
 
 
541 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  27.24 
 
 
759 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.88 
 
 
1296 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  30.41 
 
 
572 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  27.76 
 
 
530 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  24.67 
 
 
591 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  25.38 
 
 
743 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  25.16 
 
 
767 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.23 
 
 
863 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>