80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3990 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  850    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  70 
 
 		 459 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  58.08 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  57.5 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  48.11 
 
 		 465 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  51.08 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  56.17 
 
 		 448 aa  342  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.41 
 
 		 465 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  48.17 
 
 		 454 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  50.67 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  47.41 
 
 		 454 aa  332  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  49.58 
 
 		 461 aa  332  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  48.86 
 
 		 557 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.11 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  49.89 
 
 		 464 aa  326  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  48 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  46.82 
 
 		 459 aa  323  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  47.35 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  48.6 
 
 		 452 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  47.01 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  50.33 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  46.85 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  46.46 
 
 		 467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  46.33 
 
 		 479 aa  312  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  48.29 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  52.36 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  44.65 
 
 		 466 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  51.46 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  44.97 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  48.27 
 
 		 462 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.32 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  45.34 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  44.92 
 
 		 462 aa  299  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  48.38 
 
 		 457 aa  293  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  44.97 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  43.82 
 
 		 493 aa  285  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  45.3 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  45.94 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  50.13 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  49.47 
 
 		 435 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  47.62 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  43.23 
 
 		 466 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  42.03 
 
 		 477 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  46.1 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  48.47 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  44.31 
 
 		 473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  40.46 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.37 
 
 		 483 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  37.31 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.48 
 
 		 477 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.48 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  33.88 
 
 		 523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  33.56 
 
 		 532 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  35.9 
 
 		 501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.13 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  29.01 
 
 		 477 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  33.81 
 
 		 673 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  34.49 
 
 		 840 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  32.04 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.63 
 
 		 2160 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  41.07 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.15 
 
 		 767 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.37 
 
 		 362 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  27.98 
 
 		 593 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  27.27 
 
 		 523 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.38 
 
 		 1037 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1023 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.59 
 
 		 575 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.16 
 
 		 530 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  25.56 
 
 		 759 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  25.81 
 
 		 527 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  29.32 
 
 		 591 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  33.69 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.48 
 
 		 575 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  28.42 
 
 		 1359 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  33.33 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  42.86 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45402  predicted protein  35.56 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.11 
 
 		 601 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1061 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>