16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1362 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  100 
 
 		 1023 aa  2055    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  33.1 
 
 		 987 aa  185  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 842 aa  173  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1003 aa  110  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  33.94 
 
 		 834 aa  95.9  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  26.42 
 
 		 439 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.04 
 
 		 541 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  27.56 
 
 		 461 aa  49.7  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1318 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  27.48 
 
 		 459 aa  47.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  27.99 
 
 		 483 aa  47.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  28.38 
 
 		 441 aa  47.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  29.44 
 
 		 459 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.76 
 
 		 572 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  26.73 
 
 		 913 aa  45.8  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  30.83 
 
 		 460 aa  45.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>