86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4430 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 465 aa  920    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  60.58 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  63.89 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.15 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  56.57 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.82 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  56.93 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  58.69 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  56.97 
 
 		 467 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  56.69 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  59 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.02 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  58.14 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  55.3 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  62.91 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  55.51 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  56.36 
 
 		 460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  52.01 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  54.24 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  51 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  55 
 
 		 489 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  53.56 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  52.12 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  49.32 
 
 		 505 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  54.83 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.08 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  55.08 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  58.2 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  52.72 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  52.12 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  51.7 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  53.38 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  54.41 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  52.83 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  52.7 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.86 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  53.79 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  47.27 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.38 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  49.39 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  55.05 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  51.57 
 
 		 473 aa  333  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  54.32 
 
 		 415 aa  323  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  50 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.16 
 
 		 446 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  47.37 
 
 		 448 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  43.27 
 
 		 483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.68 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  39.65 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.4 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.33 
 
 		 477 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  40.14 
 
 		 501 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  37.16 
 
 		 523 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.59 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  33.25 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.88 
 
 		 483 aa  150  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  39.9 
 
 		 840 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  36.54 
 
 		 673 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  32.76 
 
 		 759 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.81 
 
 		 767 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  40.3 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  25.67 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  31.04 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  32.26 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  36.81 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.09 
 
 		 601 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  30.04 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.65 
 
 		 1037 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1318 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.38 
 
 		 1296 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  31.23 
 
 		 2160 aa  56.6  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  26.61 
 
 		 852 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.54 
 
 		 575 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  30.8 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1023 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  37.17 
 
 		 987 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.15 
 
 		 884 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1106 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  29.14 
 
 		 1332 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  33.08 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 842 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  24.5 
 
 		 572 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  46.81 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  28.83 
 
 		 863 aa  43.1  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>