67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3059 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1045    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  70.47 
 
 		 532 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  36.33 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  35.73 
 
 		 454 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  37.71 
 
 		 361 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  36.61 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  35.26 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.93 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.8 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.02 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  34.53 
 
 		 459 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  35.65 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  34.25 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  37.59 
 
 		 457 aa  183  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  35.24 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  35.85 
 
 		 452 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  34.71 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.08 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  33.27 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  34.25 
 
 		 468 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  33.66 
 
 		 509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  33.87 
 
 		 505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  44.1 
 
 		 840 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  32.94 
 
 		 459 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  33.21 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  35.18 
 
 		 465 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  36.87 
 
 		 489 aa  169  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  43.1 
 
 		 673 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  36.71 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  38.05 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  34.29 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  33.91 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  35.71 
 
 		 455 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  34.59 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  35.46 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  34 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  34.64 
 
 		 464 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  30.77 
 
 		 476 aa  156  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  31.16 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  30.5 
 
 		 454 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.49 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  32.67 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  33.2 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.24 
 
 		 478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  36.73 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  33.94 
 
 		 493 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  28.75 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  34.84 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  31.9 
 
 		 433 aa  144  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.74 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  33.57 
 
 		 432 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  31.09 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  32.05 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  32.71 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  33.08 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  31.75 
 
 		 496 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  28.85 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  26.53 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.09 
 
 		 1296 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  25.98 
 
 		 767 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  29.45 
 
 		 2160 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.02 
 
 		 541 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  37.72 
 
 		 362 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.74 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1061 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  27.22 
 
 		 575 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>