82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4370 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 450 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  67.46 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  64.29 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  62.83 
 
 		 454 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  68.1 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  64.86 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  58.97 
 
 		 452 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  61.9 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  60.16 
 
 		 479 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  57.96 
 
 		 489 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  58.71 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  59.24 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  62.02 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  60.09 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  59.23 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  55.63 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  55.27 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  53.88 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  57.92 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  56.33 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  53.03 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  58 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  55.72 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  55.22 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  56.92 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  54.47 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  48.15 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  51.9 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  52.23 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.87 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  57.27 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  59.67 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  56.29 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  55.6 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  53.62 
 
 		 464 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  59.23 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  54.25 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  55.25 
 
 		 473 aa  358  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.36 
 
 		 478 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  53.07 
 
 		 476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  55.1 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  49.03 
 
 		 466 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  58.36 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  53.66 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  51.82 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  52.72 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  39.38 
 
 		 509 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.48 
 
 		 483 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.53 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  41.18 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.51 
 
 		 477 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  37.03 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.59 
 
 		 523 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  38.62 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.49 
 
 		 477 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  27.23 
 
 		 483 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  41.05 
 
 		 840 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  39.46 
 
 		 673 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  46.9 
 
 		 168 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  31.31 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.67 
 
 		 1296 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  31.13 
 
 		 863 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.31 
 
 		 759 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.22 
 
 		 852 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  30.67 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  25.48 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  30.21 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.64 
 
 		 2160 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.5 
 
 		 1037 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  35.27 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1106 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.24 
 
 		 541 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  27.81 
 
 		 1332 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  31.65 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1318 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.57 
 
 		 884 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45402  predicted protein  29.41 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  24.6 
 
 		 593 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  24.24 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.47 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.1 
 
 		 2042 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1263 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>