83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3654 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 462 aa  903    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  69.5 
 
 		 479 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  66.53 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  67.09 
 
 		 450 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  58.09 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  59.44 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  55.2 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.62 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  58.97 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  54.41 
 
 		 459 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  56.67 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  56.47 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  57.36 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  52.59 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  57.85 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  52.02 
 
 		 460 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  58.49 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  53.93 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  51.5 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  52.88 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  58.32 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  57.75 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.14 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  59.78 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  49.61 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  55.86 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  51.9 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  55.93 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  51.6 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  51.39 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  53.47 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  51.14 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  51.6 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  55.45 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  52.98 
 
 		 557 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  51.28 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  52.12 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.64 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  55.35 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  50.21 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.49 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.68 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  51.95 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  54.25 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  46.19 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  47.59 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  39.11 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.9 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.95 
 
 		 483 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.94 
 
 		 476 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  36.51 
 
 		 523 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  41.44 
 
 		 501 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.73 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  35.91 
 
 		 477 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.33 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.95 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  43.09 
 
 		 840 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  34.83 
 
 		 673 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  46.02 
 
 		 168 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  32.55 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  41.46 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.88 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  31.89 
 
 		 2160 aa  57.4  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.67 
 
 		 884 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.2 
 
 		 767 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.26 
 
 		 863 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  26.29 
 
 		 558 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  31.06 
 
 		 530 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1061 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.77 
 
 		 1296 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  28.29 
 
 		 572 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  33.2 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  27.37 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  32.7 
 
 		 593 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.75 
 
 		 852 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  30.36 
 
 		 593 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45402  predicted protein  27.54 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1106 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.52 
 
 		 575 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  31.25 
 
 		 1332 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  29.11 
 
 		 1755 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  30.61 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>