57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3329 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 558 aa  1112    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  36.63 
 
 		 717 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  32.33 
 
 		 362 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  31.77 
 
 		 591 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.03 
 
 		 593 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  30 
 
 		 575 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.54 
 
 		 852 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  36.7 
 
 		 412 aa  87  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  31.07 
 
 		 591 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  30.09 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.2 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.68 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.27 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  27.71 
 
 		 665 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.21 
 
 		 863 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  27.21 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  25.42 
 
 		 659 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1106 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1010 aa  63.9  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1061 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  26.67 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  26.28 
 
 		 2192 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.56 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  27.57 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  32.16 
 
 		 2042 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  24.9 
 
 		 601 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 		 786 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  38.89 
 
 		 272 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  25.63 
 
 		 462 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  25.13 
 
 		 2160 aa  50.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  26.84 
 
 		 459 aa  50.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  31.88 
 
 		 465 aa  50.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  30.58 
 
 		 466 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  29.34 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1318 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  28.28 
 
 		 459 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  30.18 
 
 		 481 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  31.91 
 
 		 1234 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  30.5 
 
 		 1254 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  24.25 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  42.37 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  31.91 
 
 		 1252 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  27.64 
 
 		 454 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.54 
 
 		 759 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.87 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  31.21 
 
 		 1234 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  31.21 
 
 		 1250 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  31.21 
 
 		 1250 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.21 
 
 		 1234 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.32 
 
 		 1296 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.14 
 
 		 884 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  29.53 
 
 		 435 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  24.81 
 
 		 545 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  26.67 
 
 		 673 aa  43.5  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  26.62 
 
 		 435 aa  43.5  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  31.37 
 
 		 361 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>