23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02579 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1031    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  42.66 
 
 		 526 aa  256  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  31.89 
 
 		 659 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  31.17 
 
 		 665 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  30.04 
 
 		 591 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  30.31 
 
 		 591 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.47 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03795  putative secreted protein  94.92 
 
 		 59 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  30.66 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.17 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  28.96 
 
 		 655 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.91 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  25.84 
 
 		 518 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  31.99 
 
 		 302 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  32.48 
 
 		 384 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.29 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  32.49 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  27.89 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  30.95 
 
 		 717 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1061 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  31.65 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  25.43 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  38.55 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>