18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_54658 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  100 
 
 
422 aa  849    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  35.07 
 
 
1000 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  32.09 
 
 
591 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  32.85 
 
 
590 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  30.6 
 
 
591 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  36.7 
 
 
575 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  25.65 
 
 
575 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  30.37 
 
 
1003 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  38.55 
 
 
516 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  32 
 
 
1061 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  42.37 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  37.8 
 
 
466 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  38.18 
 
 
648 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  33.33 
 
 
439 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  36.45 
 
 
504 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  36.05 
 
 
659 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  37.88 
 
 
505 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 
665 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>