19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1078 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  66.56 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  61.06 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  30.03 
 
 		 572 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  35.9 
 
 		 659 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  35.07 
 
 		 665 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  34.84 
 
 		 591 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  36.23 
 
 		 591 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  32.32 
 
 		 516 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  32.11 
 
 		 575 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  29.15 
 
 		 655 aa  89  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  31.44 
 
 		 575 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  30.29 
 
 		 526 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.46 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.63 
 
 		 530 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  28.32 
 
 		 518 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  29.08 
 
 		 459 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  25.9 
 
 		 464 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  27.31 
 
 		 483 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>