47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3634 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 
655 aa  1308    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  31.79 
 
 
659 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  32.55 
 
 
665 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  33.99 
 
 
591 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  32.89 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  31.81 
 
 
591 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  33.01 
 
 
575 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  33.78 
 
 
575 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  30.66 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.51 
 
 
541 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.35 
 
 
530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  32.71 
 
 
526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  28.28 
 
 
572 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.88 
 
 
767 aa  94  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  31.82 
 
 
1061 aa  90.9  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  29.15 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.08 
 
 
759 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  35.48 
 
 
2192 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  34.25 
 
 
384 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  27.67 
 
 
593 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  25.1 
 
 
601 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  45.45 
 
 
2042 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.43 
 
 
593 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  27.84 
 
 
558 aa  61.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  58.33 
 
 
870 aa  60.8  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  52.38 
 
 
545 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  32.58 
 
 
1252 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  29.64 
 
 
647 aa  54.3  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  51.61 
 
 
546 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  31.67 
 
 
1234 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.13 
 
 
1234 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  32.13 
 
 
1234 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  32.13 
 
 
1250 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  32.13 
 
 
1250 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  40.79 
 
 
329 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.13 
 
 
1800 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  25.89 
 
 
2160 aa  51.2  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  51.61 
 
 
362 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03795  putative secreted protein  50 
 
 
59 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  31.63 
 
 
527 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  49.12 
 
 
786 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  28.76 
 
 
1254 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  33.04 
 
 
717 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  30.58 
 
 
731 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  33.53 
 
 
1619 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  28.72 
 
 
913 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  26.12 
 
 
799 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>