51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3086 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 665 aa  1329    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  81.64 
 
 		 659 aa  1088    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  31.57 
 
 		 655 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  33.03 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  33.27 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  32.08 
 
 		 591 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  34.22 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  31.17 
 
 		 516 aa  144  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  30.85 
 
 		 575 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.5 
 
 		 575 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  28.7 
 
 		 572 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1061 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  33.02 
 
 		 759 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  31.21 
 
 		 384 aa  97.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.44 
 
 		 767 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  34.75 
 
 		 302 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.3 
 
 		 2192 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  27.65 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  34.25 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  32.71 
 
 		 2042 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  26.97 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  25.86 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  33.52 
 
 		 870 aa  68.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  25.18 
 
 		 530 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  46.03 
 
 		 362 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.55 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  46.27 
 
 		 647 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  27.68 
 
 		 731 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  27.84 
 
 		 2160 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  27.95 
 
 		 527 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  25.27 
 
 		 1197 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.5 
 
 		 1800 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  46.03 
 
 		 545 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1010 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  28.91 
 
 		 481 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  47.46 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1106 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  43.86 
 
 		 786 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  25.49 
 
 		 593 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  28.74 
 
 		 717 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  25.54 
 
 		 461 aa  47.4  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  31.86 
 
 		 834 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  40.35 
 
 		 817 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.66 
 
 		 740 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35 
 
 		 726 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.62 
 
 		 1037 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  32.94 
 
 		 1254 aa  44.3  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  31.79 
 
 		 1250 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  31.79 
 
 		 1250 aa  44.3  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  31.79 
 
 		 1252 aa  43.9  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.79 
 
 		 1234 aa  43.9  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>