53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2156 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 526 aa  1041    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  42.3 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  36.31 
 
 		 591 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  36.95 
 
 		 591 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  34.31 
 
 		 659 aa  170  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  32.88 
 
 		 572 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  35.54 
 
 		 665 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  32.85 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  30.02 
 
 		 575 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  33.02 
 
 		 655 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  36.26 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.02 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  33.22 
 
 		 302 aa  94.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.97 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  37.5 
 
 		 2192 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  29.62 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.79 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03795  putative secreted protein  57.63 
 
 		 59 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  32.65 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.48 
 
 		 759 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.46 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  29.32 
 
 		 913 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  31.98 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  48.84 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1061 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  31.84 
 
 		 717 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  36.84 
 
 		 464 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0695  polymorphic membrane protein B/C family protein  31.71 
 
 		 1460 aa  51.2  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  33.72 
 
 		 870 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1106 aa  50.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  28.27 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  28.46 
 
 		 1359 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1010 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  25.5 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.03 
 
 		 852 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.43 
 
 		 477 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1318 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  36.79 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  25.05 
 
 		 593 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  32.98 
 
 		 2042 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  25.47 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  33.72 
 
 		 1254 aa  47  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  27.13 
 
 		 601 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  28.66 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  27.15 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  27.24 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  29.51 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  30.52 
 
 		 457 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.39 
 
 		 884 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  32 
 
 		 2160 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  37.8 
 
 		 1234 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  27.27 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>