31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5974 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 		 731 aa  1467    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5888  cysteine-rich repeat protein  30.29 
 
 		 709 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  29.02 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.18 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  36.42 
 
 		 2042 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34 
 
 		 2160 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  33.54 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  27.68 
 
 		 665 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  27.92 
 
 		 759 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  30.3 
 
 		 786 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  33.54 
 
 		 546 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  29.36 
 
 		 593 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  29.56 
 
 		 659 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  23.47 
 
 		 987 aa  51.6  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  27.32 
 
 		 518 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  41.49 
 
 		 647 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31 
 
 		 2192 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1061 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1106 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  39.8 
 
 		 1037 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  32.14 
 
 		 509 aa  47.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 		 817 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.3 
 
 		 1197 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  45.83 
 
 		 715 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  27.15 
 
 		 530 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  29.36 
 
 		 481 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.97 
 
 		 1800 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  31.58 
 
 		 593 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  48.39 
 
 		 645 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  48.39 
 
 		 644 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  30.22 
 
 		 483 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>