24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2826 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  78.44 
 
 
640 aa  924    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  76.6 
 
 
638 aa  885    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  92.07 
 
 
644 aa  1118    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
645 aa  1232    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  46.32 
 
 
648 aa  363  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  45.36 
 
 
663 aa  336  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  65.72 
 
 
342 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  42.73 
 
 
663 aa  327  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  38.86 
 
 
851 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  44.56 
 
 
420 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  33.8 
 
 
2055 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  44.97 
 
 
378 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  37.82 
 
 
537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  41.06 
 
 
309 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  55.56 
 
 
715 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  57.89 
 
 
701 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  42.77 
 
 
602 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  34.47 
 
 
315 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  52.33 
 
 
794 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  58.82 
 
 
744 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  46.75 
 
 
302 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  62.3 
 
 
780 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  48.39 
 
 
731 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5577  cysteine-rich repeat protein  33.33 
 
 
511 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>