166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2085 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
715 aa  1396    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5577  cysteine-rich repeat protein  37.99 
 
 
511 aa  208  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.99 
 
 
994 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.87 
 
 
850 aa  161  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  46.78 
 
 
2153 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  46.11 
 
 
2074 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  55.63 
 
 
701 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  48.5 
 
 
2055 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  56.21 
 
 
644 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  55.56 
 
 
645 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  48.78 
 
 
420 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  52.94 
 
 
663 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  57.35 
 
 
663 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.02 
 
 
761 aa  114  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  54.48 
 
 
648 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  40.49 
 
 
1750 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  42.33 
 
 
2816 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.93 
 
 
2507 aa  110  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  54.41 
 
 
638 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  39.46 
 
 
3927 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  41.45 
 
 
892 aa  108  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  54.41 
 
 
640 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  44.6 
 
 
3477 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  39.25 
 
 
1597 aa  104  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.87 
 
 
1884 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.29 
 
 
369 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  40.22 
 
 
2839 aa  101  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.32 
 
 
4978 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  43.03 
 
 
1867 aa  92  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  45.29 
 
 
851 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  36.19 
 
 
2377 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  47.3 
 
 
602 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  40.68 
 
 
4848 aa  89.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  32.11 
 
 
2476 aa  89.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  37.86 
 
 
5745 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.88 
 
 
2503 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.04 
 
 
3191 aa  87.4  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  34.48 
 
 
721 aa  85.5  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  51.54 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  38.73 
 
 
3474 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  35.94 
 
 
1793 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.06 
 
 
3699 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.68 
 
 
3544 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 
3699 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.5 
 
 
2114 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  35.59 
 
 
1911 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 
378 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  34.39 
 
 
814 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  33.89 
 
 
1363 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  51.55 
 
 
2542 aa  78.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  34.44 
 
 
1269 aa  77.8  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  36.08 
 
 
1512 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  33.71 
 
 
2522 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.25 
 
 
3089 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.2 
 
 
3363 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  36.25 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  33.71 
 
 
2767 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  50.57 
 
 
794 aa  74.3  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  35.85 
 
 
1502 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  37.5 
 
 
4854 aa  74.3  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  36.7 
 
 
1269 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  37.95 
 
 
1416 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.97 
 
 
1109 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  32.57 
 
 
1367 aa  72  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  43.48 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.26 
 
 
3396 aa  70.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  39.47 
 
 
2555 aa  70.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  36.7 
 
 
1268 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  31.14 
 
 
4798 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  41.82 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.03 
 
 
2807 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  37.59 
 
 
991 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  41.94 
 
 
744 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.97 
 
 
3816 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  34.55 
 
 
2353 aa  65.1  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  45.33 
 
 
436 aa  64.3  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  40.3 
 
 
139 aa  63.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  35.09 
 
 
1779 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  34.62 
 
 
7284 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  36.84 
 
 
2836 aa  62.4  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  40.22 
 
 
998 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  48 
 
 
302 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.03 
 
 
1066 aa  62  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  29.73 
 
 
2715 aa  61.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 
1141 aa  60.1  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  38.26 
 
 
891 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  35.16 
 
 
2233 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  30.23 
 
 
974 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  31.48 
 
 
1712 aa  57.4  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  39.76 
 
 
755 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.33 
 
 
4220 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  44.32 
 
 
157 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  34.75 
 
 
1538 aa  56.6  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  62.12 
 
 
780 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.4 
 
 
2281 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  31.61 
 
 
8321 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.71 
 
 
846 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.06 
 
 
1063 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  34.1 
 
 
16311 aa  54.7  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27866  predicted protein  29.07 
 
 
3182 aa  54.7  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>