23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2527 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
2055 aa  3930    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  34.31 
 
 
851 aa  236  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  37.14 
 
 
663 aa  226  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  35.06 
 
 
663 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  38.66 
 
 
640 aa  212  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  38.33 
 
 
638 aa  207  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  33.87 
 
 
648 aa  205  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  35.12 
 
 
645 aa  204  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  34.77 
 
 
644 aa  197  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  36.82 
 
 
537 aa  190  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  39.32 
 
 
420 aa  187  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  40 
 
 
309 aa  158  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  38.28 
 
 
378 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  38.94 
 
 
342 aa  128  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  48.5 
 
 
715 aa  124  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  41.84 
 
 
315 aa  115  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  53.44 
 
 
701 aa  106  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  40.74 
 
 
602 aa  95.5  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  30.07 
 
 
1793 aa  65.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  47.87 
 
 
794 aa  62.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  40.6 
 
 
744 aa  57.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 
302 aa  46.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0068  cysteine-rich repeat protein  49.33 
 
 
1001 aa  46.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>