21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2169 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
378 aa  733    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  37.5 
 
 
645 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  39.39 
 
 
644 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  37.03 
 
 
420 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  40.6 
 
 
851 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  35.52 
 
 
640 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  36.95 
 
 
638 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  44.26 
 
 
309 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  36.9 
 
 
537 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  38.34 
 
 
342 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  37.73 
 
 
663 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  34.55 
 
 
663 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  37.87 
 
 
2055 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  39.93 
 
 
648 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  43.66 
 
 
602 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  44.02 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 
715 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  29.59 
 
 
701 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  47.97 
 
 
794 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  45.63 
 
 
744 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  55.22 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>