32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5301 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 		 794 aa  1574    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  31.98 
 
 		 744 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  30.55 
 
 		 1024 aa  193  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2091  hypothetical protein  33.47 
 
 		 376 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  50.57 
 
 		 715 aa  74.3  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  43.75 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  36.31 
 
 		 420 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  35.09 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  40.28 
 
 		 851 aa  64.3  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  47.87 
 
 		 2055 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  46.6 
 
 		 701 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  41.18 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  46.73 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  38.85 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  52.33 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  52.33 
 
 		 645 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  49.44 
 
 		 638 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  49.44 
 
 		 640 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  24.21 
 
 		 897 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  42.98 
 
 		 1793 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  32.4 
 
 		 1140 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  31.08 
 
 		 931 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00785704  normal  0.0148689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 397 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.06 
 
 		 365 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  33.97 
 
 		 602 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5888  cysteine-rich repeat protein  56.76 
 
 		 709 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  24.13 
 
 		 378 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2952  hypothetical protein  26.78 
 
 		 322 aa  44.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  30.82 
 
 		 361 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30 
 
 		 1217 aa  44.3  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  46.67 
 
 		 537 aa  43.9  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>