23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0573 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
648 aa  1215    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  54.66 
 
 
663 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  52.43 
 
 
663 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  47.38 
 
 
640 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  47.4 
 
 
638 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  46.05 
 
 
645 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  44.69 
 
 
644 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  41.39 
 
 
851 aa  303  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  42.89 
 
 
420 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  36.56 
 
 
2055 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  38.81 
 
 
537 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  38.25 
 
 
342 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  38.8 
 
 
378 aa  134  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  56.78 
 
 
701 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  38.12 
 
 
309 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  54.48 
 
 
715 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  34.14 
 
 
602 aa  87.4  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  45.22 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  46.73 
 
 
794 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  56.9 
 
 
744 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  37.12 
 
 
302 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  55.41 
 
 
780 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5577  cysteine-rich repeat protein  29.65 
 
 
511 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>