22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4979 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
342 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  65.72 
 
 
645 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  67 
 
 
640 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  64.86 
 
 
644 aa  318  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  67.51 
 
 
638 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  40.37 
 
 
378 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  37.74 
 
 
648 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  42.47 
 
 
663 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  42.6 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  43.59 
 
 
2055 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  43.14 
 
 
663 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  42.26 
 
 
851 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  41.34 
 
 
420 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  42.22 
 
 
537 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  38.49 
 
 
602 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  36.05 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  36.25 
 
 
715 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  38.35 
 
 
794 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  53.33 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  43.52 
 
 
744 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  40 
 
 
701 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  68.97 
 
 
731 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>