26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1609 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
302 aa  615  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  54.46 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1383  EGF calcium-binding domain protein  36.67 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  48.08 
 
 
602 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  48 
 
 
715 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  53.33 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  50.62 
 
 
640 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5749  hypothetical protein  37.25 
 
 
432 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 
638 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  47.37 
 
 
644 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  46.75 
 
 
645 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  51.35 
 
 
663 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2880  hypothetical protein  30.84 
 
 
992 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  48 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0754  EGF calcium-binding domain protein  38.74 
 
 
460 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  55.22 
 
 
378 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 
663 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1391  EGF calcium-binding domain protein  38.14 
 
 
428 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  39.13 
 
 
537 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1717  Disintegrin  30.96 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0985  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  37.96 
 
 
851 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  49.28 
 
 
701 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  60.53 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  49.23 
 
 
2055 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  46.55 
 
 
648 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>