23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0930 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  95.13 
 
 
640 aa  1134    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  76.72 
 
 
644 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
638 aa  1211    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  76.6 
 
 
645 aa  927    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  48.07 
 
 
648 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  45.22 
 
 
663 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  65.67 
 
 
342 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  42.57 
 
 
663 aa  327  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  38.68 
 
 
851 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  42.59 
 
 
420 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  37.65 
 
 
2055 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  37.45 
 
 
537 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  40.86 
 
 
378 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  40.62 
 
 
309 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  62.28 
 
 
701 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 
715 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  45.35 
 
 
602 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  35.97 
 
 
315 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  45.54 
 
 
744 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  49.44 
 
 
794 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 
302 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  30.91 
 
 
1793 aa  53.9  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  41.58 
 
 
780 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>