57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1730 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 		 780 aa  1544    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  44.72 
 
 		 1264 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  29.95 
 
 		 782 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  42.18 
 
 		 1987 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  62.12 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5288  hypothetical protein  39.13 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  32.57 
 
 		 3662 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  44.17 
 
 		 852 aa  68.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2435  Thrombospondin type 3 repeat protein  41.36 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  41.67 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  37.74 
 
 		 851 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  54.69 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  62.3 
 
 		 644 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  58.73 
 
 		 663 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  62.3 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  39.23 
 
 		 6109 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  55.56 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  55.41 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  38.33 
 
 		 823 aa  60.1  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  58.73 
 
 		 2055 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  55.74 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.2 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  55.74 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  51.56 
 
 		 420 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  43.24 
 
 		 744 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40 
 
 		 478 aa  55.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  56.72 
 
 		 309 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1898 aa  53.5  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  33.72 
 
 		 490 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  32.23 
 
 		 1793 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 487 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 440 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  30.92 
 
 		 14609 aa  51.2  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  47.95 
 
 		 543 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  32.64 
 
 		 1831 aa  50.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 637 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  30.54 
 
 		 722 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5577  cysteine-rich repeat protein  53.66 
 
 		 511 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  36.54 
 
 		 792 aa  48.5  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  47.95 
 
 		 302 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  39.07 
 
 		 1755 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.58 
 
 		 542 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 374 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  48 
 
 		 342 aa  47.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  34 
 
 		 1369 aa  47.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.87 
 
 		 320 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.54 
 
 		 294 aa  46.6  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3470  hypothetical protein  30.48 
 
 		 2836 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0237631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 		 727 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  35.51 
 
 		 722 aa  45.8  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  31.02 
 
 		 319 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  45.83 
 
 		 544 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  38.51 
 
 		 386 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  49.02 
 
 		 794 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 		 456 aa  44.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  58.97 
 
 		 1935 aa  44.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.49 
 
 		 412 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>