More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1947 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
490 aa  980    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  39.96 
 
 
458 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  47.21 
 
 
374 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  50.97 
 
 
637 aa  216  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  34.74 
 
 
1987 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 
623 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  43.58 
 
 
1755 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.45 
 
 
447 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  41.57 
 
 
319 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.97 
 
 
478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.09 
 
 
320 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  32.39 
 
 
402 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  33.7 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.97 
 
 
544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  41.31 
 
 
386 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.5 
 
 
427 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  42.47 
 
 
386 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.67 
 
 
1264 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.53 
 
 
543 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  37.35 
 
 
727 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  33.23 
 
 
671 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.09 
 
 
542 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.37 
 
 
412 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  31.39 
 
 
487 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 
498 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  28.68 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 
417 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  49.38 
 
 
792 aa  127  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
510 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.72 
 
 
429 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.21 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.8 
 
 
506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  32.55 
 
 
322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  45.05 
 
 
722 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  38.81 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  49.03 
 
 
722 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
401 aa  106  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  41.08 
 
 
570 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40.12 
 
 
362 aa  104  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  39.74 
 
 
375 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 
375 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 
445 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  40 
 
 
365 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  34.57 
 
 
440 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  34.52 
 
 
540 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  34.33 
 
 
266 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  37.58 
 
 
348 aa  98.2  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  33.59 
 
 
314 aa  97.1  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  45.54 
 
 
311 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  36.84 
 
 
204 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 
306 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  39.25 
 
 
424 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
1026 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36.89 
 
 
510 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  41.58 
 
 
277 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  41.22 
 
 
369 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  44.55 
 
 
310 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  38.51 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  41.22 
 
 
369 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  25.81 
 
 
486 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  44.55 
 
 
310 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  44.55 
 
 
310 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  32.8 
 
 
381 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
193 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  44.55 
 
 
310 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  44.55 
 
 
310 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  44.55 
 
 
310 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  44.55 
 
 
310 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 
320 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 
369 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  38.51 
 
 
365 aa  90.1  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  36.49 
 
 
201 aa  89.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.23 
 
 
237 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 
366 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.23 
 
 
237 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 
372 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.19 
 
 
170 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.56 
 
 
344 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 
363 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  39.81 
 
 
268 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 
372 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.69 
 
 
345 aa  87.8  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.91 
 
 
344 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
316 aa  87.4  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
218 aa  87  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
380 aa  87  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 
537 aa  86.7  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 
218 aa  86.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  38.1 
 
 
1793 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
225 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  35.94 
 
 
712 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.51 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 
673 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>