More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2050 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  92.91 
 
 		 909 aa  1367    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1935 aa  3950    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  74.85 
 
 		 740 aa  967    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  93.99 
 
 		 972 aa  1392    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  30.17 
 
 		 2801 aa  426  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  29.08 
 
 		 1991 aa  345  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  29.96 
 
 		 1938 aa  320  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  28.2 
 
 		 1912 aa  306  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  28.08 
 
 		 1929 aa  297  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  30.47 
 
 		 1957 aa  296  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  29.45 
 
 		 1464 aa  204  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1600 aa  175  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1352 aa  175  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25 
 
 		 2096 aa  145  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.02 
 
 		 1599 aa  142  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.01 
 
 		 1271 aa  141  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.58 
 
 		 1433 aa  135  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  28.06 
 
 		 535 aa  130  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1917 aa  128  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.32 
 
 		 2149 aa  127  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1558 aa  125  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1942 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.35 
 
 		 1381 aa  122  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  28.11 
 
 		 2003 aa  121  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1669 aa  121  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1611 aa  119  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.45 
 
 		 2731 aa  119  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 2294 aa  119  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.78 
 
 		 678 aa  119  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.17 
 
 		 903 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  28.29 
 
 		 605 aa  117  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1840 aa  117  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 2942 aa  112  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  25.48 
 
 		 840 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.04 
 
 		 924 aa  109  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  24.18 
 
 		 1379 aa  108  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.61 
 
 		 1568 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.57 
 
 		 1586 aa  105  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.37 
 
 		 1595 aa  106  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  24.97 
 
 		 1681 aa  105  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1418 aa  105  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  26.27 
 
 		 2831 aa  103  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1550 aa  103  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  30.69 
 
 		 1710 aa  103  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.92 
 
 		 1614 aa  102  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.65 
 
 		 2277 aa  102  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1390 aa  102  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.59 
 
 		 1429 aa  102  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 927 aa  102  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  22.5 
 
 		 1530 aa  101  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1402 aa  101  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.27 
 
 		 2225 aa  101  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  34.21 
 
 		 1359 aa  100  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  28.73 
 
 		 423 aa  99.4  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 690 aa  99.4  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1400 aa  99  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1386 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.38 
 
 		 1572 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 3193 aa  97.8  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.18 
 
 		 889 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1959 aa  97.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.35 
 
 		 1509 aa  97.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 3273 aa  97.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  22.75 
 
 		 1385 aa  96.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.46 
 
 		 765 aa  96.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.6 
 
 		 1981 aa  96.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  42.61 
 
 		 284 aa  96.3  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1409 aa  94.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.53 
 
 		 1488 aa  94.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  22.92 
 
 		 1365 aa  94  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.03 
 
 		 1527 aa  93.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.2 
 
 		 2224 aa  93.6  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.2 
 
 		 2224 aa  93.6  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.13 
 
 		 1485 aa  93.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  23.34 
 
 		 1560 aa  92.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.93 
 
 		 1518 aa  92  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.49 
 
 		 2350 aa  92  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.6 
 
 		 2224 aa  91.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1531 aa  92  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1411 aa  92  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.75 
 
 		 1467 aa  91.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.63 
 
 		 3073 aa  90.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1520 aa  91.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1623 aa  90.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.57 
 
 		 1576 aa  90.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1551 aa  89.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.02 
 
 		 2178 aa  89.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 869 aa  89.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  27.77 
 
 		 2961 aa  89.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  23.14 
 
 		 1411 aa  89.4  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  23.6 
 
 		 1397 aa  89.4  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.04 
 
 		 2246 aa  89.4  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1197 aa  89.4  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  24.42 
 
 		 2221 aa  89  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  25.08 
 
 		 1998 aa  89  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  23.66 
 
 		 1411 aa  88.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  23.14 
 
 		 1377 aa  88.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  23.9 
 
 		 1345 aa  88.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  23.9 
 
 		 1345 aa  88.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  23.4 
 
 		 866 aa  89  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>