More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2048 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  88.83 
 
 		 740 aa  954    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 972 aa  1976    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  91.86 
 
 		 909 aa  1400    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  93.99 
 
 		 1935 aa  1406    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  33.41 
 
 		 2801 aa  304  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  32.68 
 
 		 1991 aa  281  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  30.94 
 
 		 1938 aa  265  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  30.42 
 
 		 1957 aa  241  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  29.96 
 
 		 1912 aa  238  5.0000000000000005e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  30.17 
 
 		 1929 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  29.88 
 
 		 1464 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  29.9 
 
 		 1600 aa  170  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.07 
 
 		 1599 aa  148  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1352 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  27.99 
 
 		 535 aa  139  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1558 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1433 aa  124  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.2 
 
 		 1271 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1840 aa  120  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  25.62 
 
 		 840 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 2003 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1917 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2096 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.73 
 
 		 1381 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.12 
 
 		 678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.39 
 
 		 924 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 423 aa  111  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1681 aa  110  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.79 
 
 		 2294 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 927 aa  110  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  29.68 
 
 		 605 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.19 
 
 		 1595 aa  109  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1390 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.33 
 
 		 1586 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 3193 aa  104  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  24.15 
 
 		 1379 aa  104  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1669 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1402 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.17 
 
 		 1614 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1418 aa  103  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.96 
 
 		 1568 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1409 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  43.97 
 
 		 284 aa  102  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.76 
 
 		 903 aa  102  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.09 
 
 		 1550 aa  101  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1611 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 869 aa  100  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.24 
 
 		 1572 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  33.33 
 
 		 1359 aa  99.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1942 aa  99.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.66 
 
 		 1981 aa  99  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1386 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.15 
 
 		 2731 aa  98.6  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  29.5 
 
 		 1710 aa  97.8  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  26.69 
 
 		 1998 aa  98.2  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.82 
 
 		 2225 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.31 
 
 		 1429 aa  97.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.08 
 
 		 765 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  28.23 
 
 		 2961 aa  96.3  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  23.26 
 
 		 1411 aa  95.1  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1147 aa  95.1  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 2942 aa  94.4  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.71 
 
 		 1509 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 690 aa  94  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  22.57 
 
 		 1732 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  22.76 
 
 		 1411 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  22.85 
 
 		 1365 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 2831 aa  93.2  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  23.36 
 
 		 1385 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.25 
 
 		 2224 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1411 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.25 
 
 		 2224 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1400 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.96 
 
 		 1488 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1411 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  23.29 
 
 		 1411 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.88 
 
 		 1467 aa  92.4  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  23.16 
 
 		 1388 aa  91.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.72 
 
 		 889 aa  92  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.18 
 
 		 1576 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 866 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.63 
 
 		 2224 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  24.02 
 
 		 1397 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1959 aa  90.1  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  22.58 
 
 		 1411 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.95 
 
 		 1517 aa  89.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.04 
 
 		 2246 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 955 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.85 
 
 		 2277 aa  89.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  23.26 
 
 		 1409 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  23 
 
 		 1377 aa  88.6  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.83 
 
 		 2178 aa  88.6  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  24.26 
 
 		 2221 aa  88.6  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.41 
 
 		 1577 aa  88.6  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  24.71 
 
 		 741 aa  88.2  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.61 
 
 		 1518 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.74 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  24.49 
 
 		 705 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.74 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1411 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>