More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0036 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  100 
 
 		 1957 aa  4020    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  57.98 
 
 		 1938 aa  1991    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  41.31 
 
 		 1929 aa  1151    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  40.73 
 
 		 1991 aa  996    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  40.82 
 
 		 1912 aa  1154    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1935 aa  290  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  38.14 
 
 		 535 aa  280  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  31.29 
 
 		 909 aa  232  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  30.02 
 
 		 972 aa  218  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  26.48 
 
 		 2801 aa  210  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  32.09 
 
 		 740 aa  184  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.87 
 
 		 1464 aa  159  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.05 
 
 		 2096 aa  127  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.1 
 
 		 1271 aa  118  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.52 
 
 		 1599 aa  113  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.99 
 
 		 1379 aa  106  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1390 aa  105  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.99 
 
 		 1600 aa  103  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  102  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1352 aa  102  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 927 aa  102  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.27 
 
 		 1560 aa  100  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.82 
 
 		 1381 aa  99.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.85 
 
 		 1467 aa  95.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.83 
 
 		 3689 aa  95.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.31 
 
 		 1981 aa  94  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1611 aa  94.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  24.27 
 
 		 1359 aa  93.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.67 
 
 		 1485 aa  92.8  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.11 
 
 		 1429 aa  92.8  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.02 
 
 		 1485 aa  90.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.6 
 
 		 788 aa  89  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.6 
 
 		 788 aa  89  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 3193 aa  88.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1368 aa  87  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.5 
 
 		 2149 aa  85.9  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  28.29 
 
 		 2225 aa  85.9  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1149 aa  85.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.99 
 
 		 3027 aa  85.5  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.98 
 
 		 1576 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 690 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.61 
 
 		 1614 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.77 
 
 		 2277 aa  84.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1146  hypothetical protein  37.31 
 
 		 109 aa  83.6  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.199573  hitchhiker  0.0000217042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1520 aa  83.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  28.99 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.73 
 
 		 924 aa  82.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1547 aa  82.4  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1558 aa  81.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.68 
 
 		 1572 aa  81.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1531 aa  79.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.05 
 
 		 1517 aa  79.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.47 
 
 		 1568 aa  79.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.35 
 
 		 1362 aa  79  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1419 aa  79  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  30.6 
 
 		 2178 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  30.14 
 
 		 2246 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  23.87 
 
 		 2224 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1433 aa  77.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 2486 aa  77  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.74 
 
 		 1586 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  28.98 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  29.96 
 
 		 765 aa  75.5  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.28 
 
 		 2035 aa  74.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.3 
 
 		 741 aa  75.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  25.11 
 
 		 764 aa  75.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.95 
 
 		 1577 aa  75.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  30.34 
 
 		 451 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.87 
 
 		 1595 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.46 
 
 		 903 aa  74.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  25.4 
 
 		 1710 aa  73.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  21.57 
 
 		 1348 aa  73.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  28.76 
 
 		 2224 aa  72.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  28.76 
 
 		 2224 aa  72.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  23.74 
 
 		 1528 aa  72.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1527 aa  72.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.33 
 
 		 2731 aa  72.4  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  22.89 
 
 		 1573 aa  72.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1400 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  23.91 
 
 		 2221 aa  72  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1149 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  26.3 
 
 		 1384 aa  71.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  24.35 
 
 		 1494 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1494 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  29.35 
 
 		 400 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1197 aa  71.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.08 
 
 		 2349 aa  71.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.82 
 
 		 1509 aa  70.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.51 
 
 		 1953 aa  70.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  22.98 
 
 		 840 aa  70.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.32 
 
 		 1508 aa  69.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  23.48 
 
 		 1411 aa  69.3  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1411 aa  69.3  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1409 aa  69.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1268 aa  69.3  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  23.89 
 
 		 1411 aa  68.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1553 aa  68.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.79 
 
 		 1550 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1147 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1426 aa  68.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>