More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2045 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 740 aa  1514    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  88.83 
 
 		 972 aa  935    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  89.58 
 
 		 909 aa  909    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  74.85 
 
 		 1935 aa  965    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  37.23 
 
 		 2801 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  34.67 
 
 		 1991 aa  225  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  31.89 
 
 		 1938 aa  211  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  33.01 
 
 		 1464 aa  207  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  32.65 
 
 		 1957 aa  203  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  31.79 
 
 		 1929 aa  188  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  31.82 
 
 		 1912 aa  187  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  29.26 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1600 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  32.98 
 
 		 678 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.58 
 
 		 1599 aa  115  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1352 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  29.41 
 
 		 605 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 2294 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1558 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  28.27 
 
 		 2003 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  30.94 
 
 		 1710 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.75 
 
 		 903 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1840 aa  99  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1942 aa  97.8  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  27.15 
 
 		 1998 aa  97.8  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  42.11 
 
 		 284 aa  96.7  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.96 
 
 		 2096 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  28.8 
 
 		 423 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  29.12 
 
 		 1681 aa  96.3  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  33.63 
 
 		 1359 aa  95.9  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  30.21 
 
 		 1568 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1917 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  31.25 
 
 		 1379 aa  92.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1669 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  30.84 
 
 		 924 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.29 
 
 		 1429 aa  90.9  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  30.14 
 
 		 2942 aa  90.9  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1531 aa  90.5  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.83 
 
 		 1271 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.24 
 
 		 2225 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  27.22 
 
 		 889 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  28.8 
 
 		 1732 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.54 
 
 		 1381 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1390 aa  86.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 913 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  26.45 
 
 		 2554 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1959 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  30 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 690 aa  84  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  28.26 
 
 		 2224 aa  84  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  28.26 
 
 		 2224 aa  84  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  27.53 
 
 		 869 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 3193 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  27.7 
 
 		 2224 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.81 
 
 		 1008 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  28.66 
 
 		 2831 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.81 
 
 		 1008 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.43 
 
 		 2658 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1400 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  27.54 
 
 		 765 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1552 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.04 
 
 		 1543 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.82 
 
 		 1614 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1410 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  24.96 
 
 		 840 aa  80.9  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  25 
 
 		 2387 aa  80.9  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  32.9 
 
 		 952 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.65 
 
 		 1345 aa  80.9  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.65 
 
 		 1345 aa  80.9  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.53 
 
 		 2350 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.27 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.27 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.84 
 
 		 1981 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  22.87 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.13 
 
 		 2221 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  29.44 
 
 		 867 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  29.13 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1386 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.09 
 
 		 1467 aa  79.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1623 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  23.2 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  27.02 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  30.92 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1409 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.58 
 
 		 1586 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.58 
 
 		 1595 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  27.6 
 
 		 1338 aa  79  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.61 
 
 		 1572 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1402 aa  78.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.44 
 
 		 927 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1611 aa  78.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.86 
 
 		 2246 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  29.6 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  22.61 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  22.61 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  22.61 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  22.61 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  28.91 
 
 		 1530 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.27 
 
 		 1421 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>