More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2868 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  34.32 
 
 
2443 aa  777    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  100 
 
 
2554 aa  5302    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  34.16 
 
 
2479 aa  1119    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  34.06 
 
 
2510 aa  1117    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  33.28 
 
 
2652 aa  1131    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  71.46 
 
 
2558 aa  3728    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  33.44 
 
 
2534 aa  743    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  29.87 
 
 
1528 aa  616  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  30.7 
 
 
1447 aa  610  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  30.64 
 
 
1446 aa  593  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  29.95 
 
 
2698 aa  578  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  29.88 
 
 
1505 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  29.86 
 
 
2417 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  29.86 
 
 
2458 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  29.1 
 
 
1489 aa  530  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  30.43 
 
 
1496 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  28.76 
 
 
1485 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  29.06 
 
 
1540 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  29.06 
 
 
1540 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  29.06 
 
 
1540 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  27.83 
 
 
1488 aa  479  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  29.7 
 
 
1976 aa  348  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  34.45 
 
 
921 aa  323  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  33.14 
 
 
886 aa  322  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  34.03 
 
 
910 aa  322  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  34.23 
 
 
952 aa  321  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  32.11 
 
 
955 aa  321  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  34.28 
 
 
881 aa  320  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  34.08 
 
 
952 aa  320  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  32.99 
 
 
940 aa  320  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  31.97 
 
 
956 aa  320  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  33.78 
 
 
929 aa  317  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  32.13 
 
 
927 aa  316  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  33.63 
 
 
958 aa  317  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  31.29 
 
 
989 aa  310  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  33.38 
 
 
980 aa  310  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  33.58 
 
 
939 aa  310  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  32.65 
 
 
994 aa  304  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  32.19 
 
 
920 aa  303  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  32.43 
 
 
952 aa  302  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  33.14 
 
 
954 aa  299  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  33.14 
 
 
954 aa  299  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  33.14 
 
 
954 aa  299  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  33.96 
 
 
852 aa  288  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  32.23 
 
 
891 aa  287  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  31.15 
 
 
958 aa  285  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  31.15 
 
 
962 aa  285  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  31.15 
 
 
962 aa  285  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  31.29 
 
 
922 aa  284  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  30.79 
 
 
923 aa  261  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  29.74 
 
 
942 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  30.28 
 
 
944 aa  255  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  29.35 
 
 
893 aa  244  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  26.77 
 
 
928 aa  232  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.38 
 
 
2031 aa  191  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.6 
 
 
2031 aa  191  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  22.92 
 
 
2031 aa  190  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.87 
 
 
1825 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.87 
 
 
1825 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.57 
 
 
2032 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.5 
 
 
1806 aa  166  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.69 
 
 
3456 aa  113  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  23.66 
 
 
1488 aa  106  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  25 
 
 
1140 aa  102  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.87 
 
 
1352 aa  100  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  22.09 
 
 
1328 aa  92.8  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.88 
 
 
1338 aa  92  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  51.9 
 
 
119 aa  92.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 
690 aa  87.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  28.09 
 
 
2059 aa  85.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.54 
 
 
1599 aa  84.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  28.09 
 
 
2035 aa  85.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.01 
 
 
1834 aa  83.2  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.36 
 
 
927 aa  82.8  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  21.44 
 
 
1433 aa  82.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 
1935 aa  81.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  21.78 
 
 
903 aa  82  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  22.15 
 
 
1429 aa  80.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  22.3 
 
 
1600 aa  80.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  21.61 
 
 
2094 aa  77.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.01 
 
 
738 aa  77.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  55.38 
 
 
103 aa  77  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  28.4 
 
 
628 aa  76.3  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.74 
 
 
2035 aa  75.9  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  21.38 
 
 
1577 aa  75.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  24.14 
 
 
2165 aa  75.5  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  27.36 
 
 
1710 aa  73.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  30.77 
 
 
1892 aa  73.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  27.67 
 
 
1126 aa  73.2  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  24.68 
 
 
2864 aa  73.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  24.67 
 
 
586 aa  72.8  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  23.02 
 
 
2145 aa  72  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  35.9 
 
 
298 aa  72  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  35.9 
 
 
316 aa  72  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 
3320 aa  71.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.16 
 
 
1959 aa  72  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  22.9 
 
 
2294 aa  71.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  22.07 
 
 
1140 aa  71.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  35.9 
 
 
298 aa  72  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  21.83 
 
 
1981 aa  70.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>