More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6268 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1623 aa  3329    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4111  YD repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1687 aa  289  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4284  YD repeat-containing protein  27.77 
 
 		 1687 aa  286  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.43 
 
 		 1271 aa  192  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.06 
 
 		 2096 aa  168  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1352 aa  160  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 2035 aa  159  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.51 
 
 		 3027 aa  152  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.13 
 
 		 1485 aa  146  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1840 aa  144  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1390 aa  141  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1917 aa  140  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1600 aa  139  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1942 aa  135  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.7 
 
 		 1959 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1147 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 2003 aa  132  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.45 
 
 		 2246 aa  131  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.39 
 
 		 765 aa  129  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  24.92 
 
 		 2224 aa  126  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  24.92 
 
 		 2224 aa  126  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.08 
 
 		 2224 aa  126  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.33 
 
 		 2225 aa  125  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 3193 aa  125  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.75 
 
 		 1576 aa  125  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.75 
 
 		 678 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25.35 
 
 		 2178 aa  124  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.76 
 
 		 1259 aa  121  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  24.77 
 
 		 2221 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.82 
 
 		 1485 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  22.21 
 
 		 1614 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.84 
 
 		 1953 aa  119  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1669 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 3689 aa  119  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.85 
 
 		 1572 aa  118  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 3273 aa  118  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1197 aa  118  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 		 3073 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.84 
 
 		 2277 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 2942 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  28.79 
 
 		 2349 aa  115  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.72 
 
 		 2658 aa  115  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.47 
 
 		 1488 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 927 aa  112  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.37 
 
 		 2731 aa  112  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1834 aa  108  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.7 
 
 		 1528 aa  108  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.63 
 
 		 1348 aa  108  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1611 aa  108  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.05 
 
 		 1543 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.89 
 
 		 903 aa  107  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  24.16 
 
 		 1579 aa  107  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.82 
 
 		 1434 aa  106  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  24.16 
 
 		 1428 aa  106  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  26.54 
 
 		 765 aa  105  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.97 
 
 		 1626 aa  105  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1586 aa  105  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.7 
 
 		 1599 aa  105  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1552 aa  104  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  27.01 
 
 		 1732 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  25.17 
 
 		 1160 aa  104  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.37 
 
 		 1362 aa  103  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 2486 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 2374 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  29.24 
 
 		 400 aa  102  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.23 
 
 		 1609 aa  102  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1386 aa  102  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.97 
 
 		 1509 aa  102  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.88 
 
 		 1345 aa  101  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.88 
 
 		 1345 aa  101  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.8 
 
 		 924 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 2294 aa  100  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  24.94 
 
 		 1494 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1494 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  23.92 
 
 		 1517 aa  100  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.06 
 
 		 1464 aa  100  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  23.55 
 
 		 1528 aa  100  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  23.65 
 
 		 1150 aa  99.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  23.87 
 
 		 1150 aa  99.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.71 
 
 		 1568 aa  99  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.57 
 
 		 1495 aa  98.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  27.07 
 
 		 504 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  21.97 
 
 		 1384 aa  98.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.41 
 
 		 1489 aa  98.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  25.34 
 
 		 1475 aa  98.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.6 
 
 		 1595 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.56 
 
 		 1518 aa  97.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1150 aa  97.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.6 
 
 		 1586 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 690 aa  97.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.85 
 
 		 1381 aa  97.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1527 aa  97.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1527 aa  97.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1008 aa  96.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1008 aa  96.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.08 
 
 		 1508 aa  96.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.65 
 
 		 1467 aa  96.7  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  21.69 
 
 		 1494 aa  96.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1189 aa  96.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1466 aa  95.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>