More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2046 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 909 aa  1845    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  91.63 
 
 		 972 aa  1402    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  90.09 
 
 		 1935 aa  1394    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  89.25 
 
 		 740 aa  931    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  31.25 
 
 		 1938 aa  279  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  31.14 
 
 		 1991 aa  272  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  31.41 
 
 		 1957 aa  258  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  30.78 
 
 		 1912 aa  252  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  30.81 
 
 		 1929 aa  246  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  31.22 
 
 		 1464 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  32.66 
 
 		 2801 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1600 aa  165  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  30.04 
 
 		 535 aa  150  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1352 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.53 
 
 		 1599 aa  144  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 2294 aa  137  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1558 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.05 
 
 		 1271 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 2003 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1433 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1840 aa  125  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.36 
 
 		 1381 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.84 
 
 		 678 aa  124  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.06 
 
 		 2096 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  25.48 
 
 		 840 aa  117  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  24.8 
 
 		 1379 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1917 aa  115  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  28.66 
 
 		 605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.38 
 
 		 869 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.6 
 
 		 924 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1942 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1611 aa  111  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.3 
 
 		 1595 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.45 
 
 		 1586 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  32.13 
 
 		 1710 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.47 
 
 		 1568 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.34 
 
 		 903 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1402 aa  107  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1390 aa  107  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 927 aa  107  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1418 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.84 
 
 		 765 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1669 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.92 
 
 		 2350 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 2942 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.66 
 
 		 1614 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.1 
 
 		 2246 aa  105  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.55 
 
 		 3193 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 690 aa  104  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.92 
 
 		 2225 aa  104  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 423 aa  104  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  44.35 
 
 		 284 aa  102  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.96 
 
 		 1981 aa  101  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1419 aa  101  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 2831 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  32.46 
 
 		 1359 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.5 
 
 		 2731 aa  99.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.29 
 
 		 1732 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1386 aa  99  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  24.58 
 
 		 2221 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.47 
 
 		 2224 aa  97.8  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  31.27 
 
 		 1998 aa  97.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.62 
 
 		 1959 aa  97.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.83 
 
 		 1429 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  23.09 
 
 		 1301 aa  96.3  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.57 
 
 		 1576 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.04 
 
 		 889 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.94 
 
 		 1467 aa  95.9  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  30.36 
 
 		 1681 aa  95.9  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.47 
 
 		 2224 aa  95.5  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.47 
 
 		 2224 aa  95.5  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.42 
 
 		 1572 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1623 aa  95.1  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  29.27 
 
 		 396 aa  94.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 955 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  29 
 
 		 2658 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  23.9 
 
 		 1539 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1008 aa  92.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  22.77 
 
 		 1400 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1008 aa  92.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1409 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  23.56 
 
 		 1539 aa  92  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  22.87 
 
 		 1365 aa  91.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  23.91 
 
 		 1573 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.82 
 
 		 1488 aa  91.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 2961 aa  90.5  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  23.47 
 
 		 1411 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  22.66 
 
 		 1385 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1411 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.49 
 
 		 2178 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 913 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  24.96 
 
 		 1345 aa  88.6  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  24.96 
 
 		 1345 aa  88.6  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  29.15 
 
 		 2349 aa  89  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1411 aa  88.6  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1147 aa  88.6  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  23.35 
 
 		 1411 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.73 
 
 		 1485 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1531 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25 
 
 		 741 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>