278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1145 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1109    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  49.34 
 
 		 1912 aa  416  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  49.01 
 
 		 1929 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  44.67 
 
 		 1991 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  38.37 
 
 		 1957 aa  280  5e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  39.74 
 
 		 1938 aa  276  5e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1146  hypothetical protein  76.12 
 
 		 109 aa  202  9e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.199573  hitchhiker  0.0000217042 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  54.03 
 
 		 284 aa  148  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  28.84 
 
 		 909 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1935 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  27.79 
 
 		 972 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  29.26 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  27.31 
 
 		 2801 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  27.46 
 
 		 1464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1600 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.1 
 
 		 1599 aa  87.4  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  25.62 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1352 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.5 
 
 		 1384 aa  83.6  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.97 
 
 		 690 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  24.37 
 
 		 1998 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.46 
 
 		 3193 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  23.35 
 
 		 869 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 2831 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1531 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.79 
 
 		 1509 aa  73.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.41 
 
 		 678 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1494 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.59 
 
 		 927 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1400 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 2961 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  23.62 
 
 		 1528 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1763 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.72 
 
 		 1576 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  27.38 
 
 		 939 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1433 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  28.29 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1381 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1611 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  28.72 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  29.86 
 
 		 867 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  29.41 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1558 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  29.38 
 
 		 1386 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  25.93 
 
 		 1681 aa  63.9  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.67 
 
 		 1572 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.74 
 
 		 1495 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.73 
 
 		 1586 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.73 
 
 		 1595 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.63 
 
 		 1379 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.87 
 
 		 1385 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.62 
 
 		 924 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.22 
 
 		 2225 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  32.88 
 
 		 952 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1411 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2203  Sel1 domain-containing protein  41.41 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0174154  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1419 aa  61.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1409 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.2 
 
 		 2096 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.34 
 
 		 1429 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.53 
 
 		 1614 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  26.09 
 
 		 1528 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 955 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0350  RHS protein  27.84 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.8 
 
 		 2003 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  22.99 
 
 		 2731 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 866 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.64 
 
 		 1259 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  30.99 
 
 		 1359 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  23.95 
 
 		 2246 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  31.51 
 
 		 989 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1488 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  23.31 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  23.49 
 
 		 2178 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  24.48 
 
 		 765 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.87 
 
 		 1568 aa  57  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2154  hypothetical protein  65.85 
 
 		 73 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307116  hitchhiker  0.00807837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.05 
 
 		 1348 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  22.34 
 
 		 1338 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  41.03 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 2294 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.65 
 
 		 1467 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  40.3 
 
 		 1426 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  40.3 
 
 		 1429 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.53 
 
 		 1489 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3339  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595806  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  31 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  22.05 
 
 		 1981 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  39.74 
 
 		 1410 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.03 
 
 		 903 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1426 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  32.2 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1527 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  40.3 
 
 		 1426 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  25.5 
 
 		 1710 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  25.81 
 
 		 400 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>