More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00658 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  100 
 
 		 554 aa  1152    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  95.41 
 
 		 477 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  95.69 
 
 		 1411 aa  735    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  95.71 
 
 		 1377 aa  744    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  94.88 
 
 		 1411 aa  733    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  96.33 
 
 		 477 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  98.05 
 
 		 1397 aa  1058    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  95.96 
 
 		 1411 aa  741    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  94.34 
 
 		 1411 aa  728    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  99.42 
 
 		 1397 aa  1074    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  88.64 
 
 		 1394 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  81.23 
 
 		 1365 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  98.25 
 
 		 1397 aa  1063    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  96.7 
 
 		 1409 aa  736    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  95.69 
 
 		 1411 aa  735    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  95.41 
 
 		 477 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  96.45 
 
 		 1399 aa  736    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  95.44 
 
 		 1377 aa  743    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  96.02 
 
 		 477 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  95.11 
 
 		 477 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  96.5 
 
 		 1411 aa  742    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  98.83 
 
 		 1397 aa  1071    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  95.41 
 
 		 477 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  96.15 
 
 		 1388 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  97 
 
 		 1308 aa  740    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  77.08 
 
 		 1426 aa  621  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  79.46 
 
 		 586 aa  621  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  77.08 
 
 		 1426 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  75.38 
 
 		 1200 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  77.08 
 
 		 1426 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  76.56 
 
 		 1429 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  75.38 
 
 		 1216 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  75.38 
 
 		 682 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  75.97 
 
 		 1268 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  76.3 
 
 		 1251 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  75.71 
 
 		 1400 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  75.52 
 
 		 1398 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  75.45 
 
 		 1405 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  73.85 
 
 		 1415 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  67.33 
 
 		 1199 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  74.52 
 
 		 1417 aa  571  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  71.8 
 
 		 1410 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  74.21 
 
 		 502 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  70.19 
 
 		 1388 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  67.92 
 
 		 1405 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  92.11 
 
 		 314 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  92.11 
 
 		 314 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  91.45 
 
 		 314 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  91.45 
 
 		 233 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  92 
 
 		 312 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  35.53 
 
 		 1490 aa  200  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  33.56 
 
 		 1509 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  33.7 
 
 		 1525 aa  196  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  33.81 
 
 		 1528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  32.34 
 
 		 1677 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  31.83 
 
 		 1770 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1679 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  64.96 
 
 		 713 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  75.27 
 
 		 236 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  75.27 
 
 		 236 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  75.27 
 
 		 236 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  75.27 
 
 		 236 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1791 aa  153  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1583 aa  136  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1547 aa  134  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  30.65 
 
 		 1573 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.97 
 
 		 1626 aa  130  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  86.76 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.47 
 
 		 1609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  86.76 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  31.02 
 
 		 1602 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  35.17 
 
 		 1317 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.65 
 
 		 1362 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  27.52 
 
 		 1434 aa  124  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  29.06 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  39.66 
 
 		 1348 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1604 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.57 
 
 		 1560 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  28.65 
 
 		 598 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  27.58 
 
 		 1654 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1492 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 690 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1527 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  38.3 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  28.79 
 
 		 693 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  45.69 
 
 		 1550 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  41.1 
 
 		 866 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  46.72 
 
 		 927 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  47.66 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  43.8 
 
 		 1409 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  42.03 
 
 		 1466 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  28 
 
 		 583 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  43.41 
 
 		 1611 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  45.38 
 
 		 1531 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1551 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.68 
 
 		 1614 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  43.97 
 
 		 1400 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  42.52 
 
 		 1520 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1586 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0772  RHS protein  46.02 
 
 		 327 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.728642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>