More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03450 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  100 
 
 		 314 aa  655    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  99.36 
 
 		 312 aa  646    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  96.5 
 
 		 1409 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  99.68 
 
 		 314 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  99.68 
 
 		 314 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  96.59 
 
 		 1388 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  54.33 
 
 		 502 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  93.42 
 
 		 1397 aa  310  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  92.11 
 
 		 1397 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  92.11 
 
 		 1397 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  91.45 
 
 		 1308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  92.11 
 
 		 1377 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  92.11 
 
 		 1377 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  91.45 
 
 		 554 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  90.79 
 
 		 1411 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  90.79 
 
 		 1411 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  90.85 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  90.79 
 
 		 1411 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  90.85 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  90.79 
 
 		 1411 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  90.85 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  90.85 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  90.85 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  90.85 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  90.79 
 
 		 1397 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  89.47 
 
 		 1411 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  89.54 
 
 		 1399 aa  297  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  88.82 
 
 		 1411 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  86.54 
 
 		 1394 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  69.1 
 
 		 586 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  67.8 
 
 		 1200 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  67.8 
 
 		 1216 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  76.47 
 
 		 1426 aa  261  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  76.47 
 
 		 1429 aa  261  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  76.47 
 
 		 1426 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  76.47 
 
 		 1426 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  67.42 
 
 		 682 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  67.61 
 
 		 1415 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  70.66 
 
 		 1398 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  76.97 
 
 		 1251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  64.25 
 
 		 1400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  64.58 
 
 		 1405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  75.66 
 
 		 1268 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  67.43 
 
 		 1199 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  74 
 
 		 1388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  73.33 
 
 		 1405 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  72 
 
 		 1417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  69.48 
 
 		 1410 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  50.67 
 
 		 1509 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  71.15 
 
 		 1365 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  65.74 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  65.74 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  65.74 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  73.12 
 
 		 236 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  79.52 
 
 		 713 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  40.28 
 
 		 1362 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  60 
 
 		 1525 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  47.02 
 
 		 1490 aa  133  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  50.39 
 
 		 1528 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  93.22 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  93.22 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  46.56 
 
 		 1770 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  33.98 
 
 		 1609 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  45.11 
 
 		 1677 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  42.04 
 
 		 1573 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  48.31 
 
 		 1626 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  48.65 
 
 		 1791 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  46.67 
 
 		 1348 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  49.04 
 
 		 1679 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  50.94 
 
 		 927 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  50 
 
 		 1560 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  32.08 
 
 		 788 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  32.08 
 
 		 788 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  44.92 
 
 		 1520 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  37.97 
 
 		 1434 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  41.88 
 
 		 561 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  46.22 
 
 		 866 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  44.64 
 
 		 598 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0772  RHS protein  49.54 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.728642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  48.65 
 
 		 1466 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  44.64 
 
 		 1409 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  43.07 
 
 		 1492 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  40.56 
 
 		 1547 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  43.07 
 
 		 693 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  45.87 
 
 		 451 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  45.79 
 
 		 1531 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  45.95 
 
 		 1550 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 414 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  41.03 
 
 		 1411 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  43.48 
 
 		 1386 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  36.24 
 
 		 1602 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  43.7 
 
 		 1620 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  45.87 
 
 		 171 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  37.33 
 
 		 1527 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1731  hypothetical protein  78.18 
 
 		 67 aa  99.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.338731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3884  RHS protein  34.25 
 
 		 231 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  49.06 
 
 		 690 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  43.85 
 
 		 1586 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>