More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2049 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  37.76 
 
 		 1525 aa  870    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  76.46 
 
 		 1679 aa  2343    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  87.03 
 
 		 1677 aa  2676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  94.21 
 
 		 1791 aa  2935    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1770 aa  3562    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  42.89 
 
 		 1509 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  42.89 
 
 		 1528 aa  542  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1490 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  34.8 
 
 		 1400 aa  366  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  34.57 
 
 		 1398 aa  365  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  35.12 
 
 		 1426 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  33.4 
 
 		 1429 aa  360  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  34.45 
 
 		 1268 aa  358  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  35 
 
 		 1426 aa  358  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  35 
 
 		 1426 aa  358  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  34.75 
 
 		 1405 aa  356  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  33.91 
 
 		 1410 aa  353  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  33.68 
 
 		 1251 aa  351  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  34.03 
 
 		 1417 aa  351  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  33.49 
 
 		 1394 aa  347  8e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  33.53 
 
 		 1399 aa  348  8e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  33.49 
 
 		 1409 aa  347  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  33.53 
 
 		 1397 aa  345  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  33.76 
 
 		 1411 aa  343  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  33.14 
 
 		 1388 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  33.9 
 
 		 1411 aa  342  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  35.14 
 
 		 1388 aa  342  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  33.49 
 
 		 1411 aa  341  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  33.26 
 
 		 1411 aa  341  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  33.14 
 
 		 1308 aa  341  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1411 aa  341  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  33.9 
 
 		 1397 aa  341  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  33.41 
 
 		 1405 aa  340  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  33.37 
 
 		 1365 aa  339  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  33.49 
 
 		 1397 aa  340  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  33.26 
 
 		 1377 aa  339  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  33.26 
 
 		 1411 aa  338  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  33.66 
 
 		 1377 aa  338  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  33.26 
 
 		 1397 aa  336  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  33.1 
 
 		 1415 aa  328  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  35.9 
 
 		 713 aa  259  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1319 aa  244  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1317 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1216 aa  239  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  27.08 
 
 		 1200 aa  238  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1199 aa  212  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  29.1 
 
 		 682 aa  201  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1583 aa  199  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  31.25 
 
 		 1626 aa  194  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1604 aa  192  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1620 aa  191  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1547 aa  189  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1602 aa  183  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  30.11 
 
 		 1560 aa  181  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  30.95 
 
 		 586 aa  179  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  31.83 
 
 		 554 aa  175  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  35.06 
 
 		 477 aa  171  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  35.06 
 
 		 477 aa  169  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  34.02 
 
 		 477 aa  168  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  34.02 
 
 		 477 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  34.02 
 
 		 477 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  34.02 
 
 		 477 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  34.75 
 
 		 502 aa  163  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.47 
 
 		 1362 aa  160  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1586 aa  149  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.12 
 
 		 2277 aa  147  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  25.11 
 
 		 1446 aa  146  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.05 
 
 		 2035 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1654 aa  139  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  30.66 
 
 		 414 aa  136  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  25.64 
 
 		 855 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  25.49 
 
 		 1229 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  53.15 
 
 		 451 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  57.89 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  54.05 
 
 		 1573 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  57.89 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  48.78 
 
 		 1409 aa  128  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  51.82 
 
 		 171 aa  127  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  51.79 
 
 		 867 aa  126  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1554 aa  126  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  23.49 
 
 		 1421 aa  126  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  48.44 
 
 		 1550 aa  123  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.19 
 
 		 1981 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  48.09 
 
 		 312 aa  122  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  43.03 
 
 		 598 aa  122  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  21.89 
 
 		 3027 aa  121  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  41.41 
 
 		 1609 aa  121  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  50.45 
 
 		 480 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  29.24 
 
 		 690 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  45.3 
 
 		 561 aa  121  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  50.45 
 
 		 1411 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  47.33 
 
 		 314 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  47.33 
 
 		 314 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1551 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1527 aa  118  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1531 aa  118  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  46.56 
 
 		 314 aa  118  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  48.65 
 
 		 866 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.43 
 
 		 1429 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  48.65 
 
 		 1400 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>