More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4081 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  75.75 
 
 		 1426 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  96.21 
 
 		 1411 aa  989    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  97.01 
 
 		 1377 aa  996    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  97.01 
 
 		 1411 aa  996    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  97.41 
 
 		 1397 aa  998    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  75.94 
 
 		 1426 aa  754    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 713 aa  1466    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  96.21 
 
 		 1411 aa  989    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  75.49 
 
 		 1405 aa  766    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  96.41 
 
 		 1397 aa  987    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  75.3 
 
 		 1398 aa  759    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  98.2 
 
 		 1409 aa  1007    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  74.7 
 
 		 1429 aa  751    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  96.01 
 
 		 1365 aa  986    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  98.2 
 
 		 1399 aa  1006    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  98.2 
 
 		 1394 aa  1009    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  66.27 
 
 		 1415 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  67.65 
 
 		 1417 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  95.81 
 
 		 1397 aa  982    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  68.24 
 
 		 1410 aa  693    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  83.94 
 
 		 1251 aa  860    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  96.81 
 
 		 1411 aa  994    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  75.1 
 
 		 1400 aa  757    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  96.61 
 
 		 1411 aa  992    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  96.41 
 
 		 1411 aa  990    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  75.75 
 
 		 1268 aa  751    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  68.15 
 
 		 1388 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  97.21 
 
 		 1308 aa  999    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  97.21 
 
 		 1388 aa  999    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  97.41 
 
 		 1377 aa  998    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  96.81 
 
 		 1397 aa  991    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  75.75 
 
 		 1426 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  63.25 
 
 		 1405 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  81.73 
 
 		 1199 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  72.44 
 
 		 1216 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  71.62 
 
 		 1200 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  43.07 
 
 		 1490 aa  365  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  36 
 
 		 1677 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  35.15 
 
 		 1791 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  35.87 
 
 		 1679 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  36.16 
 
 		 1525 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  35.66 
 
 		 1770 aa  253  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  35.83 
 
 		 1528 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  35.92 
 
 		 1509 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  99.04 
 
 		 290 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  99.04 
 
 		 290 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1319 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1317 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  64.96 
 
 		 554 aa  160  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  66.07 
 
 		 477 aa  154  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  66.07 
 
 		 477 aa  154  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  66.07 
 
 		 477 aa  154  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  66.07 
 
 		 477 aa  154  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  66.07 
 
 		 477 aa  153  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  66.07 
 
 		 477 aa  154  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  80.72 
 
 		 314 aa  150  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  80.72 
 
 		 314 aa  150  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  79.52 
 
 		 314 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  80.72 
 
 		 312 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  79.52 
 
 		 233 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  83.54 
 
 		 236 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  83.54 
 
 		 236 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  83.54 
 
 		 236 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  83.54 
 
 		 236 aa  147  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  61.82 
 
 		 682 aa  146  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  79.75 
 
 		 586 aa  145  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  50 
 
 		 502 aa  137  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1604 aa  105  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.3 
 
 		 1485 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1583 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  31.8 
 
 		 1531 aa  99.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  30.28 
 
 		 561 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1400 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  50 
 
 		 1348 aa  94  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  34.7 
 
 		 690 aa  93.6  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  31.51 
 
 		 451 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  34.05 
 
 		 1362 aa  92  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  41.46 
 
 		 1626 aa  91.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  30.72 
 
 		 866 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  31.05 
 
 		 1409 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1411 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1611 aa  90.5  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  53.52 
 
 		 1602 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  33.47 
 
 		 1390 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  33.06 
 
 		 927 aa  89.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3794  Rhs family protein  46.08 
 
 		 357 aa  89  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  34.35 
 
 		 1418 aa  88.6  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  51.81 
 
 		 1573 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  46 
 
 		 1554 aa  88.6  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  32.22 
 
 		 1586 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  32.22 
 
 		 1595 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  43.1 
 
 		 1550 aa  87.4  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  32.47 
 
 		 1517 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 598 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  30.73 
 
 		 867 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.8 
 
 		 1528 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1825  Rhs family protein  64.62 
 
 		 190 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.337988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  32 
 
 		 924 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1402 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  47.47 
 
 		 1466 aa  86.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>