More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0258 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  76.86 
 
 
1426 aa  792    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  89.73 
 
 
1200 aa  1093    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  70.94 
 
 
1411 aa  709    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  76.89 
 
 
1377 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  70.34 
 
 
1411 aa  703    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  89.9 
 
 
682 aa  1090    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  76.36 
 
 
1397 aa  695    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  76.86 
 
 
1426 aa  793    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  80.41 
 
 
1410 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  70.54 
 
 
1411 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  84.83 
 
 
1405 aa  765    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  76.86 
 
 
1426 aa  792    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  76.27 
 
 
1394 aa  688    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  77.35 
 
 
1308 aa  695    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  100 
 
 
586 aa  1218    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  76.86 
 
 
1429 aa  789    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  68.12 
 
 
1398 aa  769    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  88.18 
 
 
1415 aa  1070    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  83.18 
 
 
1417 aa  753    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  73.48 
 
 
1409 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  76.82 
 
 
1397 aa  701    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  67.18 
 
 
1388 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  76.66 
 
 
1377 aa  695    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  77.05 
 
 
1397 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  80.32 
 
 
1199 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  70.34 
 
 
1411 aa  704    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  81.88 
 
 
1251 aa  739    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  77.42 
 
 
1399 aa  695    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  70.94 
 
 
1411 aa  709    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  84.7 
 
 
1268 aa  771    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  76.59 
 
 
1397 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  89.73 
 
 
1216 aa  1092    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  69.94 
 
 
1411 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  84.1 
 
 
1400 aa  757    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  72.12 
 
 
1365 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  58.01 
 
 
1388 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  79.46 
 
 
554 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  68.56 
 
 
1405 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  79.6 
 
 
502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  79.32 
 
 
477 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  79.32 
 
 
477 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  79.01 
 
 
477 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  78.7 
 
 
477 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  78.7 
 
 
477 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  78.7 
 
 
477 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  69.66 
 
 
314 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  69.66 
 
 
314 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  69.1 
 
 
314 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  69.1 
 
 
233 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  69.89 
 
 
312 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  34.75 
 
 
1490 aa  200  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  32.99 
 
 
1525 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  32.65 
 
 
1509 aa  193  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  31.77 
 
 
1528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  31.98 
 
 
1679 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  31.38 
 
 
1770 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  41.63 
 
 
236 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  42.06 
 
 
236 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  42.06 
 
 
236 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  42.06 
 
 
236 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  31.81 
 
 
1677 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.88 
 
 
1547 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  33.06 
 
 
1791 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.88 
 
 
1520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.88 
 
 
1551 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  79.75 
 
 
713 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.67 
 
 
1527 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 
1550 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  30.38 
 
 
1583 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  28.88 
 
 
583 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  28.67 
 
 
598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.33 
 
 
1609 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.19 
 
 
1560 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 
1604 aa  135  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  29.33 
 
 
1434 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.25 
 
 
1626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.08 
 
 
1492 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 
693 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  31.91 
 
 
1362 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  28.25 
 
 
414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 
1466 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.76 
 
 
1620 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  30.34 
 
 
1319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  43.67 
 
 
1348 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  47.86 
 
 
1573 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  31.21 
 
 
1317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  28 
 
 
1654 aa  114  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 
1554 aa  114  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  80.33 
 
 
290 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  80.33 
 
 
290 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  40.65 
 
 
1531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  49.52 
 
 
1611 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.11 
 
 
1528 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  49.06 
 
 
1586 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  28.51 
 
 
1384 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  49.06 
 
 
1595 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  33.99 
 
 
1402 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  47.86 
 
 
1614 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  40.3 
 
 
1359 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  30.06 
 
 
1576 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>