More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3751 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  78.01 
 
 		 1679 aa  2355    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  81.87 
 
 		 1791 aa  2617    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1677 aa  3358    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  86.96 
 
 		 1770 aa  2706    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  40.09 
 
 		 1525 aa  872    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  43 
 
 		 1528 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  42.89 
 
 		 1509 aa  549  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  32.83 
 
 		 1490 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  34.91 
 
 		 1398 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  35.03 
 
 		 1400 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  32.55 
 
 		 1429 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  35.12 
 
 		 1426 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1426 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1268 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  34.99 
 
 		 1426 aa  367  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  34.37 
 
 		 1410 aa  363  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  34.87 
 
 		 1405 aa  363  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1251 aa  361  7e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  34.6 
 
 		 1417 aa  360  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  35.63 
 
 		 1388 aa  354  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  33.57 
 
 		 1399 aa  351  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  33.65 
 
 		 1409 aa  349  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  33.65 
 
 		 1394 aa  349  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  33.65 
 
 		 1397 aa  347  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1411 aa  347  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  33.88 
 
 		 1411 aa  346  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1397 aa  345  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  33.53 
 
 		 1411 aa  345  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1411 aa  345  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  33.76 
 
 		 1411 aa  345  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  33.29 
 
 		 1388 aa  344  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1405 aa  343  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  33.76 
 
 		 1397 aa  343  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  33.29 
 
 		 1308 aa  343  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  33.88 
 
 		 1365 aa  343  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  33.53 
 
 		 1377 aa  342  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  33.53 
 
 		 1411 aa  342  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  33.95 
 
 		 1377 aa  342  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  33.65 
 
 		 1397 aa  340  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  33.68 
 
 		 1415 aa  338  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  35.83 
 
 		 713 aa  264  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1319 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1317 aa  247  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  27.18 
 
 		 1200 aa  233  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1216 aa  233  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1199 aa  224  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1586 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1550 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1520 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1527 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  29.79 
 
 		 682 aa  197  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1551 aa  194  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.51 
 
 		 1609 aa  192  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  31.64 
 
 		 1620 aa  191  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1547 aa  190  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1583 aa  190  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1604 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  31.28 
 
 		 598 aa  185  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  32.99 
 
 		 1560 aa  184  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  32.57 
 
 		 554 aa  181  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.5 
 
 		 1626 aa  181  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  31.22 
 
 		 583 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  32.03 
 
 		 586 aa  173  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  34.6 
 
 		 477 aa  172  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1602 aa  172  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  34.6 
 
 		 477 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  34.6 
 
 		 477 aa  168  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  34.6 
 
 		 477 aa  168  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  34.6 
 
 		 477 aa  168  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  34.33 
 
 		 477 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  32.54 
 
 		 502 aa  162  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25 
 
 		 1362 aa  157  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 2035 aa  155  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  21.4 
 
 		 2096 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.66 
 
 		 2277 aa  148  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.78 
 
 		 1446 aa  147  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1386 aa  136  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1654 aa  136  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  26.7 
 
 		 553 aa  135  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  34.06 
 
 		 414 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  57.89 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1410 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  57.89 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.21 
 
 		 1385 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1554 aa  127  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.99 
 
 		 1400 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1419 aa  122  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  28.1 
 
 		 1573 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1531 aa  122  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.17 
 
 		 1981 aa  122  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1411 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  45.65 
 
 		 312 aa  120  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  33.53 
 
 		 422 aa  119  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  44.93 
 
 		 314 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  44.93 
 
 		 314 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.21 
 
 		 3027 aa  117  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.24 
 
 		 1429 aa  117  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  44.2 
 
 		 314 aa  116  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  50.45 
 
 		 451 aa  116  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  44.2 
 
 		 233 aa  115  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>