More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2521 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  34.13 
 
 		 1377 aa  638    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  41.24 
 
 		 1679 aa  895    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  34.69 
 
 		 1409 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  33.84 
 
 		 1397 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  99.13 
 
 		 1528 aa  2764    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  34.47 
 
 		 1791 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  34.15 
 
 		 1388 aa  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  34.95 
 
 		 1400 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  34 
 
 		 1397 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  88.8 
 
 		 1525 aa  2658    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1509 aa  3070    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  33.99 
 
 		 1399 aa  635  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  35.2 
 
 		 1426 aa  634  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1490 aa  636  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  33.99 
 
 		 1377 aa  635  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  32.45 
 
 		 1394 aa  635  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  34.63 
 
 		 1398 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  33.65 
 
 		 1397 aa  635  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  34.1 
 
 		 1411 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  34.78 
 
 		 1426 aa  631  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  33.96 
 
 		 1411 aa  632  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  33.84 
 
 		 1397 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  33.87 
 
 		 1411 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1426 aa  631  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  33.85 
 
 		 1308 aa  630  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  33.89 
 
 		 1411 aa  629  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1411 aa  629  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1268 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  34.24 
 
 		 1429 aa  625  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  34.26 
 
 		 1405 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  33.8 
 
 		 1411 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  33.47 
 
 		 1410 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  33.26 
 
 		 1251 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  33.93 
 
 		 1365 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  33.72 
 
 		 1417 aa  602  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1405 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  33.26 
 
 		 1388 aa  589  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  32.96 
 
 		 1415 aa  581  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  34.8 
 
 		 1319 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  42.89 
 
 		 1677 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  42.67 
 
 		 1770 aa  533  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1216 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  33.09 
 
 		 1200 aa  506  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1317 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1199 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1604 aa  351  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1586 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1583 aa  335  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  30.75 
 
 		 1620 aa  332  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.3 
 
 		 1626 aa  319  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.23 
 
 		 1609 aa  314  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.56 
 
 		 1348 aa  303  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.26 
 
 		 1362 aa  297  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1419 aa  283  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.45 
 
 		 1446 aa  279  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.93 
 
 		 1421 aa  278  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  35.17 
 
 		 502 aa  274  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1531 aa  274  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1602 aa  273  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.98 
 
 		 1981 aa  269  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1654 aa  266  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  29.64 
 
 		 1530 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1554 aa  258  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.58 
 
 		 1429 aa  253  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  35.83 
 
 		 713 aa  250  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1547 aa  250  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27.53 
 
 		 1385 aa  249  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1400 aa  248  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1411 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.26 
 
 		 1560 aa  240  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1386 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1550 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1229 aa  235  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  31.89 
 
 		 682 aa  232  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1520 aa  233  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  46.96 
 
 		 312 aa  228  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  50.67 
 
 		 314 aa  227  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  50.67 
 
 		 314 aa  227  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  50.67 
 
 		 314 aa  227  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  26.15 
 
 		 1593 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.67 
 
 		 1379 aa  224  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1410 aa  221  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.03 
 
 		 1434 aa  218  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1551 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1527 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  54.3 
 
 		 233 aa  215  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1409 aa  211  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.64 
 
 		 1568 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  23.93 
 
 		 1428 aa  199  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  33.56 
 
 		 554 aa  196  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  32.65 
 
 		 586 aa  193  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  28.96 
 
 		 866 aa  191  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  34.82 
 
 		 477 aa  189  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  35.1 
 
 		 477 aa  188  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  35.1 
 
 		 477 aa  188  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  35.1 
 
 		 477 aa  188  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  35.1 
 
 		 477 aa  188  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  35.1 
 
 		 477 aa  187  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  26.96 
 
 		 1140 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1418 aa  186  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>